最近在实验室做的一个项目中,需要把大量的数据在 web 端进行可视化,需要绘制各类图表。数据都是以 csv 文件的形式保存在服务器中。本来是想使用 D3.js 这个数据可视化前端库来画图,但是需要编写大量的 js 代码。后来发现了 Bokeh 这个框架,只需要在后端编写及少量的 Python 代码生成对应的 html 与 js,再传送到前端让浏览器解析,大大的减少了工作量。
1. 波形图
这里绘制一个包含了数千个数据点的信号波形图,绘制方法和 Matlab 如出一辙。学习成本为零。
import pandas as pd
from bokeh.plotting import figure
from bokeh.io import output_file, show
csv_file = 'points.csv'
data = pd.read_csv(csv_file)
TOOLS = 'hover,crosshair,pan,wheel_zoom,box_zoom,reset,save,box_select'
picture = figure(width=1000, height=400, tools=TOOLS)
picture.line(data['order'], data['value'], color='blue', alpha=0.5)
output_file('waveform.html', title='waveform')
show(picture)
points.csv
中包含了 2048 个点。上面这段脚本是直接生成了一个 html 文件,show(picture)
语句打开了这个 html 文件。效果如下:
右侧的工具栏是通过
TOOLS = 'hover,crosshair,pan,wheel_zoom,box_zoom,reset,save,box_select'
设置的。包含了常见的一些功能,包括缩放,保存,重置等等。由于的 markdown 不支持直接插入 div 块和 js 脚本,所以只能截取一个图放在这里,不能体验到右侧的工具栏的使用感受。
2. 集成到 Django 中
上面的例子是直接生成了一个 html 文件,但在正常的使用中,只应该生成对应的 div 和 js 就行了。
在 Django 的 view.py
中,定义一个 view。
def waveform(request):
csv_file = 'your file'
data = pd.read_csv(csv_file)
TOOLS = "hover,crosshair,pan,wheel_zoom,box_zoom,reset,save,box_select"
picture = figure(width=1200, height=400, tools=TOOLS)
picture.line(data['order'], data['value'], color='blue', alpha=0.5)
script, div = components(picture, CDN)
return render(request, 'waveform.html', {'script': script, 'div': div})
这样就把对应的 template 的 waveform.html
中:
{% load static %}
Experiment with Bokeh
{{ script |safe }}
{{ div |safe }}
这里有一个不太好的地方,把 script 放到了 head 里面。
然而要是放在底部。就不能正确画出图了。(求大神解答)
3. 时频图
在经过短时傅里叶变换输出的结果,可以用 image
来显示时频分布图。与 Matlab 画出来的也是如出一辙。
import numpy as np
import pandas as pd
from bokeh.io import output_file, show
from bokeh.plotting import figure
data = pd.read_csv('tf_stft.csv')
value = np.array(data['value'])
d = np.reshape(value, (338, 124))
d = np.transpose(d)
TOOLS = "hover,crosshair,pan,wheel_zoom,box_zoom,reset,save,box_select"
p = figure(x_range=(0, 62), y_range=(0, 169), tools=TOOLS)
p.image(image=[d], x=0, y=0, dw=62, dh=169, palette="Viridis256")
output_file("image.html", title="image.py example")
show(p)
结果如下:
如果是使用 D3.js 来绘制这个图形的话,就比较费劲了。
4. 小结
Bokeh 这个框架,比起 D3.js,它的可视化选项相对较少。因此,目前来看 Bokeh 无法挑战 D3.js 的霸主地位。而且 Bokeh 过于依赖 python 的数值计算库,并非一个纯前端的框架,使得它的使用范围也小于 D3.js。而在纯 python 的数值计算领域,也已经有 matplotlib 这种提供了与 Matlab 一模一样的接口的数据可视化库,Bokeh 的适用场景也并不多。
但是,它非常适合嵌入 Flask 或者 Django 的程序中,非常好用,速度也很快。