学习小组Day4笔记-鹅

学习内容

1.安装R（基础）和Rstudio（人性化一些的界面）

注意：所有的软件都安装在c盘哦，然后系统用户名最好是不要用中文，写代码最怕中文字符串哦！

• 生信0基础第一步，下载R和Rstudio并且安装在自己的电脑上面。官网链接是
  R:下载地址
  RStudio：下载地址
• 下载后根据提示先装R再装RStudio（用搜狗微信搜索：[“果子学生信 给自己一个全新的R语言环境”]查看地址
  ，也可看生信技能树（哔哩哔哩有教程））

2.粗略了解R语言是什么，干什么的，认识Rstudio的工作界面

• R语言资源汇总：地址
  
  

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• R是一种编程语言，也是统计计算和绘图的环境，它汇集了许多函数，能够提供强大的功能。
  R语言软件界面简陋，通常不直接使用，而是用图形界面的Rstudio。
  RStudio是免费提供的开源集成开发环境（IDE）。RStudio提供了一个具有很多功能的环境，使R更容易使用，是在终端中使用R的绝佳选择。

  
  
  

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尝试作图

1. plot(rnorm(50))

• plot() 默认做散点图，rnorm(50) 产生50个服从正态分布的随机数
• plot()函数是R中画x-y两个变量的函数；用runif()函数产生了两列随机数：x1,y1，然后用plot()函数直接画图。
  rnorm()函数产生一系列的随机数，随机数个数，均值和标准差都可以设定。

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2.boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink"))

• boxplot() 用于绘制盒式图，col 用于设置绘图的颜色，横坐标irisSepal.Length
• iris是一个R语言自带的数据框，通常用作示例。iris$Sepal.Length表示iris数据框的Sepal.Length这一列数据。以此类推。
• 具体更多详情可见R语言boxplot绘图函数地址

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3.学会外观设置和基本操作

• 下载打开后在tools----global opations设置分别设置pakage和外观

  
  
  

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• 基本操作

1. 用Rproject管理工作目录
   所谓工作目录就是默认的读取和储存位置，也就是说，R语言只能和一个文件夹进行互动，这个文件夹非常重要，做不好就会导致你的脚本、文件、图片各种乱跑，找不到。
   查看这一篇，养成好习惯：
   正常情况下关于工作目录的介绍是：
   设置工作目录：setwd()
   查看工作目录：getwd()
   这样的话，只设置了一个工作目录。下面介绍如何并行多个项目，也就是多个工作目录。
   第一步：绿色加号灰色底——new directory——new project——命名及路径选择【填好文件夹名后（其实给文件夹命名了，也就等于给project命名了，二者同名）点击Create Project，就打开了一个新的session，不干扰目前正在进行的项目】
   这个方法是从生信技能树的R语言视频中学来的。附上链接：
   第二步：打开project
   生信技能树创始人jimmy推荐，只用这一个方法打开Rstudio。那么下次再要打开这个项目时，只需要在文件夹中找到这个R project，双击打开即可。

2.显示文件列表
直接打命令不跟路径会显示哪里？显示默认路径，也就是工作目录。
相当于linux的ls。

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3.加减乘除

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4.赋值

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• 赋值符号用<-，这是小于号加上减号，也可以按Alt加上减号
  x<- 1+2 意思是把1+2的运算结果赋值给x， 赋值后，x会显示在右上角的框，Environment里的Value列表里
  直接输入x 回车，就会把x的值（3）打印到控制台上,前面的那个[1]是结果的第一个。
  5.删除变量
  > a<-3
> b <- 1
> c <- 4
> u <- 5+6
> rm(b)
> rm(u,c)
> rm(list = ls())#清空所有变量
  6.列出历史命令
  history()
  7.清空控制台
  快捷键ctrl+l

结语

（如果已经安装或者基础较好，可以看下R for Data Science的第一章，系统学习作图。 对照原书看，百度R for Data Science 第一个结果就是了，免费。）