python小程序--计算序列碱基个数

在处理基因组信息的时候，我们时不时需要统计序列的碱基个数，对于较少批量的数据来说，word文档或者其他文本处理工具或者samtools等可以进行处理，但是在面对大的fastq文件的时候，会显得苍白无力，下面分别介绍两种处理方式

1.针对单个序列进行处理

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2.针对序列文件

对于文件处理是建立在对单个序列处理的基础之上的，通过对文件的逐行读取和判断来辨别序列行，从而对其进行计数，计数原理一样。

按照上述小程序进行运行可以得出序列的碱基个数。