医学影像公开数据集

医学影像数据是非常珍贵的资源，收集和标注要耗费很大的人力和财力。今天这篇文章我将分享目前为止做过的医学影像诊断的一些公开数据集。
1、数字视网膜图像的血管提取（DRIVE）数据库
DRIVE数据库用于研究视网膜图像中的血管分割，由40组图像组成。下载地址：http://www.isi.uu.nl/Research/Databases/DRIVE/download.php
2、肺图像数据库联盟（LIDC）
肺图像数据库联盟（LIDC）是支持一个机构联盟制定螺旋CT肺部影像资源的共识指南，并建立螺旋CT肺部影像数据库。可用于包括癌症筛查，诊断，图像引导干预和治疗在内的应用的图像处理和CAD评估。下载地址：https://luna16.grand-challenge.org/download/
3、右心室分割数据库(RVDS)
测量心脏功能第一步就依赖于心脏图像的心室分割。相对左心室，右心室分割具有很大挑战性：在腔内存在与心机相似的信号强度；右心室是复杂的新月形，从基部到顶部一直变化；分割顶点图像的切片十分困难；患者的心室内形态和信号强度差异相当大，特别是病理改变的病历等。下载地址：http://www.litislab.fr/?sub_project=how-to-download-the-data。
4、动脉粥样硬化斑块分割(APS)
颈动脉硬化是脑血管病变的主要危险因素，不稳定的颈动脉硬化斑块破裂脱落是脑梗死发生的重要机制。超声检查因具有安全、无创、简便、可重复性等优点成为诊断颈动脉粥样硬化斑块的首选影像学检查手段。下载地址：
http://www.medinfo.cs.ucy.ac.cy/index.php/downloads/datasets/128-imt-segmentation

https://cloud.tencent.com/developer/article/1759560?from=article.detail.1651944
一、胰腺分割数据集
数据下载链接：
http://academictorrents.com/details/80ecfefcabede760cdbdf63e38986501f7becd49
数据介绍：包含82个病例的胰腺数据集。
二、MICCAI胰腺分割数据集
数据下载链接：http://medicaldecathlon.com/
数据介绍：282个训练病例，139个测试病例，同时分割胰腺和肿瘤，测试集label是hidden的。
三、The National Library of Medicine presents MedPix
数据下载链接：https://medpix.nlm.nih.gov/home
数据介绍：MedPix®是一个免费的开放式在线访问数据库，其中包含医学图像，教学案例和临床主题，集成了图像和文本元数据，包括12,000多个患者案例，9,000个主题和近59,000个图像。我们的主要目标受众包括医师和护士，专职医疗人员，医学生，护理生以及其他对医学知识感兴趣的人。内容材料按疾病位置（器官系统）组织；病理类别患者资料；以及通过图像分类和图像标题。该集合可按患者症状和体征，诊断，器官系统，图像形式和图像描述，关键字，特约作者和许多其他搜索选项进行搜索。
四、阿尔茨海默氏病神经影像数据
数据下载链接：http://adni.loni.usc.edu/data-samples/access-data/
数据介绍：阿尔茨海默氏病患者和健康对照的MRI数据库。还具有临床，基因组和生物制造商数据。

五、结肠癌CT数据
数据下载链接：
https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/CT+COLONOGRAPHY#dc149b9170f54aa29e88f1119e25ba3e
数据介绍：CT扫描诊断结肠癌。包括没有息肉，6-9mm息肉和大于10mm息肉的患者的数据。该系列中有825例带有XLS片的病例，提供了息肉描述及其在结肠段中的位置。

六、用于视网膜提取的数字视网膜图像
数据下载链接：
https://www.isi.uu.nl/Research/Databases/DRIVE/download.php
数据介绍：用于视网膜图像中血管分割的比较研究，它由40张照片组成，其中7张显示出轻度早期糖尿病性视网膜病变的迹象。

七、AMRG Cardiac Atlas（心脏MRI图像）
数据下载链接：
http://www.cardiacatlas.org/studies/amrg-cardiac-atlas/
数据介绍：奥克兰MRI研究小组的Siemens Avanto扫描仪采集的正常患者心脏的完整带标签MRI图像集。

八、先天性心脏病（CHD）图集
数据下载链接：
https://data.gov.uk/dataset/f13fbd0e-fc8a-4d42-82ef-d40f930e4b70/congenital-heart-disease-chd
数据介绍：先天性心脏病（CHD）图集代表来自患有各种先天性心脏病的成年人和儿童的MRI数据集，生理临床数据和计算机模型。
九、大脑MRI数据集
数据下载链接：http://www.oasis-brains.org/
数据介绍：OASIS影像研究开放获取系列（OASIS）是一个旨在向科学界免费提供大脑的MRI数据集的项目。有两个数据集：横截面和纵向集。年轻，中年，非痴呆和痴呆老年人的横断面MRI数据：此集合包括416名18至96岁的受试者的横断面集合。非痴呆和痴呆老年人的纵向MRI数据：该组纵向收集了150名年龄在60至96岁之间的受试者。两次或两次以上就诊时对每个受试者进行了扫描，相隔至少一年，共进行373次成像。

十、Isic Archive（黑色素瘤）
数据下载链接：
https://github.com/GalAvineri/ISIC-Archive-Downloader
数据介绍：该档案库包含分类皮肤损伤的23k图像。它包含了恶性和良性的例子。每个示例均包含病变的图像，有关病变的元数据（包括分类和分割）以及有关患者的元数据。

十一、森尼布鲁克心脏数据
数据下载链接：http://www.cardiacatlas.org/studies/
数据介绍：Sunnybrook心脏数据（SCD）也称为2009心脏MR左心室分割挑战数据，由来自以下患者和病理混合的45幅cine-MRI图像组成：健康，肥大，伴有梗塞和心脏的心力衰竭。

十二、肺部图像数据库联盟（LIDC）
数据下载链接：
https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/LIDC-IDRI#
数据介绍：肺图像数据库联合会图像收集（LIDC-IDRI）包括诊断性和肺癌筛查性胸部X线断层扫描（CT）扫描，并标明带注释的病变。它是可通过网络访问的国际资源，用于开发，培训和评估用于肺癌检测和诊断的计算机辅助诊断（CAD）方法。由美国国立癌症研究所（NCI）发起，并由美国国立卫生研究院（FNIH）基金会进一步推动，并在食品药品监督管理局（FDA）的积极参与下，这种公私合作伙伴关系证明了一项成功的研究成果。

十三、INbreast：数字化乳腺摄影数据库
数据库下载链接：
http://medicalresearch.inescporto.pt/breastresearch/index.php/Get_INbreast_Database
数据库介绍：INbreast数据库是一个乳腺摄影数据库，其中的图像是从位于大学医院（葡萄牙波尔图的乳腺癌中心，圣若昂医院）的乳腺癌中心获取的。INbreast共有115例（410幅图像），其中90例来自双乳女性（每例4幅图像），而25例来自乳房切除术患者（每例2幅图像）。包括几种类型的病变（肿块，钙化，不对称和变形）。专家还以XML格式提供了精确的轮廓。
十四、前列腺癌数据集
数据下载链接：
http://www.ehealthlab.cs.ucy.ac.cy/index.php/facilities/32-software/218-datasets
数据介绍：
1、图像格式：关于数据集的某些技术方面，T2-W MRI，DCE MRI和DWI MRI，ADC将以DICOM格式交付。
2、关于MRSI数据将以RDA（西门子）或DICOM（GE）格式提供。
3、以DICOM格式提供每种形式的所有地面真实图像。
Ground Truth：
对于每种方式，都提供了一组Ground Truth。GT由四个不同类别组成：（i）前列腺，（ii）边缘区（PZ），（iii）中央腺体（CG），（iv）CaP。
十五、SCR数据库（胸部X光片中的分割）
数据下载链接：http://www.isi.uu.nl/Research/Databases/SCR/
数据介绍：所有胸部X光片均取自JSRT数据库，这是一个公开可用的数据库，其中包含247张PA胸片。在每幅图像中，都对肺野，心脏和锁骨进行了手动分割，以提供参考标准。