主要是对该项目dgl/examples/pytorch/metapath2vec at master · dmlc/dgl · GitHub中代码的理解。
对于metapath2vec.py文件内容:
import torch
import argparse
import torch.optim as optim
from torch.utils.data import DataLoader
from tqdm import tqdm
from reading_data import DataReader, Metapath2vecDataset
from model import SkipGramModel
from download import AminerDataset, CustomDataset
class Metapath2VecTrainer:
def __init__(self, args):
if args.aminer:
dataset = AminerDataset(args.path)
else:
dataset = CustomDataset(args.path)
self.data = DataReader(dataset, args.min_count, args.care_type)
dataset = Metapath2vecDataset(self.data, args.window_size)
self.dataloader = DataLoader(dataset, batch_size=args.batch_size,
shuffle=True, num_workers=args.num_workers, collate_fn=dataset.collate)
self.output_file_name = args.output_file
self.emb_size = len(self.data.word2id)
self.emb_dimension = args.dim
self.batch_size = args.batch_size
self.iterations = args.iterations
self.initial_lr = args.initial_lr
self.skip_gram_model = SkipGramModel(self.emb_size, self.emb_dimension)
self.use_cuda = torch.cuda.is_available()
self.device = torch.device("cuda" if self.use_cuda else "cpu")
if self.use_cuda:
self.skip_gram_model.cuda()
def train(self):
optimizer = optim.SparseAdam(list(self.skip_gram_model.parameters()), lr=self.initial_lr)
scheduler = torch.optim.lr_scheduler.CosineAnnealingLR(optimizer, len(self.dataloader))
for iteration in range(self.iterations):
print("\n\n\nIteration: " + str(iteration + 1))
running_loss = 0.0
for i, sample_batched in enumerate(tqdm(self.dataloader)):
if len(sample_batched[0]) > 1:
pos_u = sample_batched[0].to(self.device)
pos_v = sample_batched[1].to(self.device)
neg_v = sample_batched[2].to(self.device)
scheduler.step()
optimizer.zero_grad()
loss = self.skip_gram_model.forward(pos_u, pos_v, neg_v)
loss.backward()
optimizer.step()
running_loss = running_loss * 0.9 + loss.item() * 0.1
if i > 0 and i % 500 == 0:
print(" Loss: " + str(running_loss))
self.skip_gram_model.save_embedding(self.data.id2word, self.output_file_name)
if __name__ == '__main__':
parser = argparse.ArgumentParser(description="Metapath2vec")
#parser.add_argument('--input_file', type=str, help="input_file")
parser.add_argument('--aminer', action='store_true', help='Use AMiner dataset')
parser.add_argument('--path', type=str, help="input_path")
parser.add_argument('--output_file', type=str, help='output_file')
parser.add_argument('--dim', default=128, type=int, help="embedding dimensions")
parser.add_argument('--window_size', default=7, type=int, help="context window size")
parser.add_argument('--iterations', default=5, type=int, help="iterations")
parser.add_argument('--batch_size', default=50, type=int, help="batch size")
parser.add_argument('--care_type', default=0, type=int, help="if 1, heterogeneous negative sampling, else normal negative sampling")
parser.add_argument('--initial_lr', default=0.025, type=float, help="learning rate")
parser.add_argument('--min_count', default=5, type=int, help="min count")
parser.add_argument('--num_workers', default=16, type=int, help="number of workers")
args = parser.parse_args()
m2v = Metapath2VecTrainer(args)
m2v.train()
main函数部分,主要用到 argparse --- 命令行选项、参数和子命令解析器 — Python 3.8.13 文档
使用 argparse 的第一步是创建一个 ArgumentParser 对象:
parser = argparse.ArgumentParser(description="Metapath2vec")
之后,给一个 ArgumentParser 添加程序参数信息是通过调用 add_argument() 方法完成的:
prog - 程序的名称(默认值:
sys.argv[0]
)usage - 描述程序用途的字符串(默认值:从添加到解析器的参数生成)
description - 在参数帮助文档之前显示的文本(默认值:无)
epilog - 在参数帮助文档之后显示的文本(默认值:无)
parents - 一个 ArgumentParser 对象的列表,它们的参数也应包含在内
formatter_class - 用于自定义帮助文档输出格式的类
prefix_chars - 可选参数的前缀字符集合(默认值: '-')
fromfile_prefix_chars - 当需要从文件中读取其他参数时,用于标识文件名的前缀字符集合(默认值:
None
)argument_default - 参数的全局默认值(默认值:
None
)conflict_handler - 解决冲突选项的策略(通常是不必要的)
add_help - 为解析器添加一个
-h/--help
选项(默认值:True
)allow_abbrev - 如果缩写是无歧义的,则允许缩写长选项 (默认值:
True
)
对于action参数:
参考文献:
如果需要在jupyter内部传参,需要传进去一个list,格式为:
['参数1', '参数1取值', '参数2', '参数2取值', '参数3', '参数3取值']
例如:
args = parser.parse_args(['--aminer','--path',"/data1/personal",'--output_file',"/data1/personal/metapath2vec_output"])
print(args)
输出:
这个确认是通过https://python.iitter.com/other/302175.html中的内容,把其中
import argparse
import configparser
if __name__ == "__main__":
jupyter = True # 如果不在jupyter notebook中,就改为False.
parser = argparse.ArgumentParser(description='test')
parser.add_argument('--batch_size', type=int, default=64)
parser.add_argument('--num_layers', type=int, default=2)
arg_list = None
if jupyter:
# load from config.ini,如果是用jupyter, 就转换配置为list再传入argparse
config = configparser.ConfigParser()
config.read('config.ini')
# 其实是个字典:
# print(config['train']['batch_size'])
arg_list = []
for k, v in config['train'].items():
arg_list.append("--"+k)
arg_list.append(v)
最后的arg_list打印出来确认的。
参考文献: