解决R语言报错:Error in y + 1:non-numeric argument to binary operator

目录

• 报错信息：
• 报错原因：
• 原代码：
• 报错原因解析：
• 总结

因为花了2天半才解决，中间痛苦的寻找，记录一下解决的流程与经验

报错信息：

1Error in y + 1 : non-numeric argument to binary operator

报错原因：

数据不是可计算的 numeric 或 integer 类型

原代码：

a = read.table(file = study.txt", sep = "\t",
  header = T, row.names = 1
  )
class(a[3, 3])    # integer
aa = t(d)
class(aa[3, 3])   # character
b = sparcc(aa)
# 出现报错
Error in y + 1 : non-numeric argument to binary operator

报错原因解析：

1. 转置后数据类型变为character，因为numeric数据中存在character类型的脏数据

（原因：转置函数t() 是先将dataframe转换为矩阵matrix，而matrix只有一种数据类型。所以如果存在character，所有数据都会被转换成character）

如何发现是否有character脏数据：

read.table设置参数colClasses = “numeric”（确保数据框内只有numeric类型）

a = read.table(file = study.txt", sep = "\t",
  header = T, row.names = 1
  colClasses = "numeric"   # 添加的参数
  )
  
  # 出现报错
  Error in scan(file = file, what = what, sep = sep, quote = quote, dec = dec,  : 
  scan() expected 'a real', got 'f__Cenarchaeaceae'

报错意为 数据框内存在“f__Cenarchaeaceae”，不属于numeric

查看txt内部

2. 引入character脏数据的原因

# 后续分析需要：设置data第一列列名为空格
genus <- data[1]
colnames(genus) <- " "
# 根据列名提取子集
 a <- subset(data, select = (disID[, 1]))

subset()函数将列名为 空格blank 的也提取了，导致了character脏数据的进入

总结

到此这篇关于解决R语言报错:Error in y + 1:non-numeric argument to binary operator的文章就介绍到这了,更多相关R语言报错1Error in y + 1 内容请搜索脚本之家以前的文章或继续浏览下面的相关文章希望大家以后多多支持脚本之家！