如何在Rstudio中debug

        本人不是R的重度使用者，作为菜鸟记录一下使用Rstudio的使用感想。

      我的使用场景主要是生成数据建模报告。R notebook支持Markdown，而且保存成html格式可以保留图表的交互性，代码写完了，报告也完成了，不需要再转移到PPT或者在Word里面纠结贴图和表格的格式。这一点是我离不开R notebook的原因。

        不过在刚接触R的时候很纠结的一点是不熟悉Rstudio中的debug模式。实际上Rstudio提供很人性化的debug方式。当运行出现错误时，在报错区域的右上角有追踪的按钮，如果报错信息不够清晰的话，可追踪到具体出错的位点。

       如下图，错误信息是逐层显示的。最下面的第一行是在console中运行出错的语句。这里调用了自定义函数lasso_analysis，函数定义保存在蓝色字标注的文件中，出错位置在该文件的第76行。

点击蓝色字，打开对应文件并在错误行加深背景显示

如果还不清楚出错原因或者希望追踪此时的局部变量情况，在希望停止的行号前单击左键加入断点。对应地，在变量窗口处，已加载的函数lasso_analysis()前也会出现存在断点的提示。

此时再运行lasso_analysis()这个函数，会在运行76行之前停止，Console窗口上新增debug工具条，从左到右分别是运行下一行，进入子函数，完成所在循环体，运行至下一个断点以及终止进程。此时变量窗口显示的是函数内的局部变量。

一般来说，我会倾向于将较大段的代码封装成函数，并把一份报告中使用的所有函数以及调用包的library命令放在一个R script文件中。在R notebook的开头加入source语句进行函数加载。由于一些数据读入和检查的代码在不同的项目中重复利用率很高，这样保存的方式也比较方便代码转移，报告中的代码段也比较简洁。

目前对于 R 自定义函数中全局变量和局部变量的定义还不是很清楚。在MATLAB或C中如果不传入或者外部声明全局，在函数内是无法调用外部变量的，但是R似乎只要不与内部变量重名都没有什么取值的问题。实际上R有环境管理的一套体系，研究过后再来记录。