NumPy基础知识（八）

NumPy基础知识（八）

• 数据类型
• 数组创建
• 使用NumPy进行I / O
• 索引编制
• 广播
• 字节交换
• 结构化数组

• 编写自定义数组容器

• 子数组ndarray

 

 

编写自定义数组容器

建议使用numpy版本v1.16中引入的Numpy的分派机制来编写与numpy API兼容并提供numpy功能的自定义实现的自定义N维数组容器。应用程序包括dask数组，分布在多个节点上的N维数组和cupy数组，GPU上的N维数组。

为了使您有编写自定义数组容器的感觉，我们将以一个简单的示例开始，该示例的实用程序非常狭窄，但说明了其中涉及的概念。

>>>

>>> import numpy as np
>>> class DiagonalArray:
...     def __init__(self, N, value):
...         self._N = N
...         self._i = value
...     def __repr__(self):
...         return f"{self.__class__.__name__}(N={self._N}, value={self._i})"
...     def __array__(self):
...         return self._i * np.eye(self._N)
...

我们的自定义数组可以像这样实例化：

>>>

>>> arr = DiagonalArray(5, 1)
>>> arr
DiagonalArray(N=5, value=1)

我们可以使用numpy.array或 转换为numpy数组numpy.asarray，这将调用其__array__方法以获得标准numpy.ndarray。

>>>

>>> np.asarray(arr)
array([[1., 0., 0., 0., 0.],
       [0., 1., 0., 0., 0.],
       [0., 0., 1., 0., 0.],
       [0., 0., 0., 1., 0.],
       [0., 0., 0., 0., 1.]])

如果我们使用arrnumpy函数进行操作，则numpy将再次使用该 __array__接口将其转换为数组，然后以通常的方式应用该函数。

>>>

>>> np.multiply(arr, 2)
array([[2., 0., 0., 0., 0.],
       [0., 2., 0., 0., 0.],
       [0., 0., 2., 0., 0.],
       [0., 0., 0., 2., 0.],
       [0., 0., 0., 0., 2.]])

请注意，返回类型是standard numpy.ndarray。

>>>

>>> type(arr)
numpy.ndarray

我们如何通过此函数传递自定义数组类型？Numpy允许类通过接口__array_ufunc__和指示其希望以自定义方式处理计算__array_function__。让我们一次开始一个_array_ufunc__。此方法涵盖 通用函数（ufunc），这是一类函数，其中包括 numpy.multiply和numpy.sin。

该__array_ufunc__接收：

• ufunc，类似 numpy.multiply

• method，一个字符串，区分numpy.multiply(...)和的变体，如numpy.multiply.outer，numpy.multiply.accumulate等等。在通常情况下numpy.multiply(...)，。method == '__call__'

• inputs，可能是不同类型的混合物

• kwargs，将关键字参数传递给函数

对于此示例，我们将仅处理方法__call__。

>>>

>>> from numbers import Number
>>> class DiagonalArray:
...     def __init__(self, N, value):
...         self._N = N
...         self._i = value
...     def __repr__(self):
...         return f"{self.__class__.__name__}(N={self._N}, value={self._i})"
...     def __array__(self):
...         return self._i * np.eye(self._N)
...     def __array_ufunc__(self, ufunc, method, *inputs, **kwargs):
...         if method == '__call__':
...             N = None
...             scalars = []
...             for input in inputs:
...                 if isinstance(input, Number):
...                     scalars.append(input)
...                 elif isinstance(input, self.__class__):
...                     scalars.append(input._i)
...                     if N is not None:
...                         if N != self._N:
...                             raise TypeError("inconsistent sizes")
...                     else:
...                         N = self._N
...                 else:
...                     return NotImplemented
...             return self.__class__(N, ufunc(*scalars, **kwargs))
...         else:
...             return NotImplemented
...

现在，我们的自定义数组类型通过numpy函数传递。

>>>

>>> arr = DiagonalArray(5, 1)
>>> np.multiply(arr, 3)
DiagonalArray(N=5, value=3)
>>> np.add(arr, 3)
DiagonalArray(N=5, value=4)
>>> np.sin(arr)
DiagonalArray(N=5, value=0.8414709848078965)

在这一点上不起作用。arr + 3

>>>

>>> arr + 3
TypeError: unsupported operand type(s) for *: 'DiagonalArray' and 'int'

为了支持它，我们需要定义Python接口__add__，__lt__等等，以分派到相应的ufunc。我们可以通过继承mixin方便地实现此目的 NDArrayOperatorsMixin。

>>>

>>> import numpy.lib.mixins
>>> class DiagonalArray(numpy.lib.mixins.NDArrayOperatorsMixin):
...     def __init__(self, N, value):
...         self._N = N
...         self._i = value
...     def __repr__(self):
...         return f"{self.__class__.__name__}(N={self._N}, value={self._i})"
...     def __array__(self):
...         return self._i * np.eye(self._N)
...     def __array_ufunc__(self, ufunc, method, *inputs, **kwargs):
...         if method == '__call__':
...             N = None
...             scalars = []
...             for input in inputs:
...                 if isinstance(input, Number):
...                     scalars.append(input)
...                 elif isinstance(input, self.__class__):
...                     scalars.append(input._i)
...                     if N is not None:
...                         if N != self._N:
...                             raise TypeError("inconsistent sizes")
...                     else:
...                         N = self._N
...                 else:
...                     return NotImplemented
...             return self.__class__(N, ufunc(*scalars, **kwargs))
...         else:
...             return NotImplemented
...

>>>

>>> arr = DiagonalArray(5, 1)
>>> arr + 3
DiagonalArray(N=5, value=4)
>>> arr > 0
DiagonalArray(N=5, value=True)

现在让我们解决__array_function__。我们将创建将numpy函数映射到我们的自定义变量的字典。

>>>

>>> HANDLED_FUNCTIONS = {}
>>> class DiagonalArray(numpy.lib.mixins.NDArrayOperatorsMixin):
...     def __init__(self, N, value):
...         self._N = N
...         self._i = value
...     def __repr__(self):
...         return f"{self.__class__.__name__}(N={self._N}, value={self._i})"
...     def __array__(self):
...         return self._i * np.eye(self._N)
...     def __array_ufunc__(self, ufunc, method, *inputs, **kwargs):
...         if method == '__call__':
...             N = None
...             scalars = []
...             for input in inputs:
...                 # In this case we accept only scalar numbers or DiagonalArrays.
...                 if isinstance(input, Number):
...                     scalars.append(input)
...                 elif isinstance(input, self.__class__):
...                     scalars.append(input._i)
...                     if N is not None:
...                         if N != self._N:
...                             raise TypeError("inconsistent sizes")
...                     else:
...                         N = self._N
...                 else:
...                     return NotImplemented
...             return self.__class__(N, ufunc(*scalars, **kwargs))
...         else:
...             return NotImplemented
...    def __array_function__(self, func, types, args, kwargs):
...        if func not in HANDLED_FUNCTIONS:
...            return NotImplemented
...        # Note: this allows subclasses that don't override
...        # __array_function__ to handle DiagonalArray objects.
...        if not all(issubclass(t, self.__class__) for t in types):
...            return NotImplemented
...        return HANDLED_FUNCTIONS[func](*args, **kwargs)
...

一种方便的模式是定义一个装饰器implements，该装饰器可用于向添加功能HANDLED_FUNCTIONS。

>>>

>>> def implements(np_function):
...    "Register an __array_function__ implementation for DiagonalArray objects."
...    def decorator(func):
...        HANDLED_FUNCTIONS[np_function] = func
...        return func
...    return decorator
...

现在，我们为编写numpy函数的实现DiagonalArray。为了完整起见，要支持用法，请arr.sum()添加一个sum调用方法，该方法numpy.sum(self)与相同mean。

>>>

>>> @implements(np.sum)
... def sum(arr):
...     "Implementation of np.sum for DiagonalArray objects"
...     return arr._i * arr._N
...
>>> @implements(np.mean)
... def mean(arr):
...     "Implementation of np.mean for DiagonalArray objects"
...     return arr._i / arr._N
...
>>> arr = DiagonalArray(5, 1)
>>> np.sum(arr)
5
>>> np.mean(arr)
0.2

如果用户尝试使用未包含的任何numpy函数 HANDLED_FUNCTIONS，TypeError则numpy将引发a ，表示不支持此操作。例如，连接两个 DiagonalArrays不会产生另一个对角线数组，因此不支持它。

>>>

>>> np.concatenate([arr, arr])
TypeError: no implementation found for 'numpy.concatenate' on types that implement __array_function__: []

此外，我们的实现，sum并且mean不接受numpy实现的可选参数。

>>>

>>> np.sum(arr, axis=0)
TypeError: sum() got an unexpected keyword argument 'axis'

用户总是具有转换为正常的选择numpy.ndarray与 numpy.asarray和使用标准numpy的从那里。

>>>

>>> np.concatenate([np.asarray(arr), np.asarray(arr)])
array([[1., 0., 0., 0., 0.],
       [0., 1., 0., 0., 0.],
       [0., 0., 1., 0., 0.],
       [0., 0., 0., 1., 0.],
       [0., 0., 0., 0., 1.],
       [1., 0., 0., 0., 0.],
       [0., 1., 0., 0., 0.],
       [0., 0., 1., 0., 0.],
       [0., 0., 0., 1., 0.],
       [0., 0., 0., 0., 1.]])

有关自定义数组容器的更多完整示例，请参阅dask源代码和 cupy源代码。

另请参阅NEP 18。