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<title>医疗影像数据预处理-nrrd-three.js webgl - loaders - NRRD loadertitle>
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<style>
#inset {
width: 150px;
height: 150px;
background-color: transparent; /* or transparent; will show through only if renderer alpha: true */
border: none; /* or none; */
margin: 0;
padding: 0px;
position: absolute;
left: 20px;
bottom: 20px;
z-index: 100;
}
style>
head>
<body>
<div id="info">
<a href="https://WebGLStudy.COM" target="_blank" rel="noopener">WebGLStudy.COMa> -
ThreeJS【WebGL】载入NRRD医疗影像数据CT_3D骨头扫描切片3D可视化
div>
<div id="inset">div>
<script type="module">
import * as THREE from '../build/three.module.js';
import Stats from './jsm/libs/stats.module.js';
import { GUI } from './jsm/libs/dat.gui.module.js';
import { TrackballControls } from './jsm/controls/TrackballControls.js';
import { NRRDLoader } from './jsm/loaders/NRRDLoader.js';
import { VTKLoader } from './jsm/loaders/VTKLoader.js';
var container, // dom 标签容器
stats, // 帧率检测
camera,// 相机
controls, // 相机控件
scene, // 场景
renderer, // 渲染器
container2,// dom 标签容器
renderer2, // 渲染器二
camera2, // 相机二
axes2, // 坐标系
scene2; // 场景二
init(); // 初始化
animate(); // 运动
function init() {
// 透视投影相机:THREE.PerspectiveCamera(fov, aspect, near, far),遵循近大远小的空间规则
camera = new THREE.PerspectiveCamera( 60, window.innerWidth / window.innerHeight, 0.01, 1e10 );
/*
fov: 垂直方向夹角
aspect:可视区域长宽比 width/height
near:渲染区域离摄像机最近的距离
far:渲染区域离摄像机最远的距离,3仅在距离摄像机near和far间的区域会被渲染到 canvas中
*/
camera.position.z = 300; // camera.position:控制相机在整个3D环境中的位置(取值为3维坐标对象-THREE.Vector3(x,y,z))
scene = new THREE.Scene(); // 场景(Scene)
scene.add( camera ); // 在场景中添加相机
// light 光
var dirLight = new THREE.DirectionalLight( 0xffffff ); // 平行光 所有被照射的区域亮度是一致的
dirLight.position.set( 200, 200, 1000 ).normalize(); // 设置平行光方向
camera.add( dirLight );
camera.add( dirLight.target );
var loader = new NRRDLoader(); // 加载模型文件
console.log(loader)
loader.load( "./1.nrrd", function ( volume ) {
console.log(volume)
var geometry,
material,
sliceZ,
sliceY,
sliceX;
//box helper to see the extend of the volume
var geometry = new THREE.BoxBufferGeometry( volume.xLength, volume.yLength, volume.zLength ); // 长方体
var material = new THREE.MeshBasicMaterial( { color: 0x00ff00 } ); // 材质
var cube = new THREE.Mesh( geometry, material );
cube.visible = false;
var box = new THREE.BoxHelper( cube ); // 给立方体设置边框
scene.add( box );
box.applyMatrix4( volume.matrix ); // 立方体最大位置
scene.add( cube );
//z plane ??
sliceZ = volume.extractSlice( 'z', Math.floor( volume.RASDimensions[ 2 ] / 4 ) );
scene.add( sliceZ.mesh );
//y plane
sliceY = volume.extractSlice( 'y', Math.floor( volume.RASDimensions[ 1 ] / 2 ) );
scene.add( sliceY.mesh );
//x plane
sliceX = volume.extractSlice( 'x', Math.floor( volume.RASDimensions[ 0 ] / 2 ) );
scene.add( sliceX.mesh );
gui.add( sliceX, "index", 0, volume.RASDimensions[ 0 ], 1 ).name( "indexX" ).onChange( function () {
sliceX.repaint.call( sliceX );
} );
gui.add( sliceY, "index", 0, volume.RASDimensions[ 1 ], 1 ).name( "indexY" ).onChange( function () {
sliceY.repaint.call( sliceY );
} );
gui.add( sliceZ, "index", 0, volume.RASDimensions[ 2 ], 1 ).name( "indexZ" ).onChange( function () {
sliceZ.repaint.call( sliceZ );
} );
gui.add( volume, "lowerThreshold", volume.min, volume.max, 1 ).name( "Lower Threshold" ).onChange( function () {
volume.repaintAllSlices();
} );
gui.add( volume, "upperThreshold", volume.min, volume.max, 1 ).name( "Upper Threshold" ).onChange( function () {
volume.repaintAllSlices();
} );
gui.add( volume, "windowLow", volume.min, volume.max, 1 ).name( "Window Low" ).onChange( function () {
volume.repaintAllSlices();
} );
gui.add( volume, "windowHigh", volume.min, volume.max, 1 ).name( "Window High" ).onChange( function () {
volume.repaintAllSlices();
} );
} );
var vtkmaterial = new THREE.MeshLambertMaterial( { wireframe: false, morphTargets: false, side: THREE.DoubleSide, color: 0xff0000 } );
var vtkloader = new VTKLoader();
vtkloader.load( "./bone_1.vtk", function ( geometry ) {
geometry.computeVertexNormals();
var mesh = new THREE.Mesh( geometry, vtkmaterial ); // mesh 物体对象
scene.add( mesh );
var visibilityControl = {
visible: true
};
gui.add( visibilityControl, "visible" ).name( "Model Visible" ).onChange( function () {
mesh.visible = visibilityControl.visible;
renderer.render( scene, camera );
} );
} );
// renderer
renderer = new THREE.WebGLRenderer( { alpha: true } );
renderer.setPixelRatio( window.devicePixelRatio ); //设置canvas的像素比为当前设备的屏幕像素比,避免高分屏下模糊
renderer.setSize( window.innerWidth, window.innerHeight );//设置渲染器大小,即canvas画布的大小
container = document.createElement( 'div' );
document.body.appendChild( container );
container.appendChild( renderer.domElement ); //在页面容器中添加canvas
controls = new TrackballControls( camera, renderer.domElement ); // 轨迹球控制器,通过键盘和鼠标控制前后左右平移和缩放场景
controls.rotateSpeed = 5.0;
controls.zoomSpeed = 5;
controls.panSpeed = 2;
controls.staticMoving = true;
stats = new Stats(); // 帧率监测器
container.appendChild( stats.dom );
var gui = new GUI(); //
setupInset();
window.addEventListener( 'resize', onWindowResize, false ); // 实时监听·
}
function onWindowResize() {
camera.aspect = window.innerWidth / window.innerHeight;
camera.updateProjectionMatrix();
renderer.setSize( window.innerWidth, window.innerHeight );
controls.handleResize();
}
function animate() {
requestAnimationFrame( animate );
controls.update();
//copy position of the camera into inset
camera2.position.copy( camera.position );
camera2.position.sub( controls.target );
camera2.position.setLength( 300 );
camera2.lookAt( scene2.position );
renderer.render( scene, camera );
renderer2.render( scene2, camera2 );
stats.update();
}
function setupInset() {
var insetWidth = 150,
insetHeight = 150;
container2 = document.getElementById( 'inset' );
container2.width = insetWidth;
container2.height = insetHeight;
// renderer
renderer2 = new THREE.WebGLRenderer( { alpha: true } );
renderer2.setClearColor( 0x000000, 0 );
renderer2.setSize( insetWidth, insetHeight );
container2.appendChild( renderer2.domElement );
// scene
scene2 = new THREE.Scene();
// camera
camera2 = new THREE.PerspectiveCamera( 50, insetWidth / insetHeight, 1, 1000 );
camera2.up = camera.up; // important!
// axes
axes2 = new THREE.AxesHelper( 100 );
scene2.add( axes2 );
}
script>
body>
html>
解释:
如果您只是想展示的话,那么直接把
> loader.load("./1.nrrd", function(volume)中的nrrd文件和
> vtkloader.load( "./bone_1.vtk", function ( geometry ) 中的vtk文件改成自己的就ok
如果你想修改参数的设置话,建议您学习一遍three.js的初级基础教程,
这个链接我就不发了,网上有教程,在哔哔哩哩上也有免费的教程,5天肯定能学完基础的
除html外,还需要three.js包文件
直接去我的码云上有这个案例,可以整体copy下来直接运行。
git地址–https://gitee.com/geyixia/html–threejs–nrrd-vtk
还可以在这里点击下载,支持一下博主
项目源代码
html运行3d文件需要启动本地服务–运行解释(小白注意哈)
请注意:
代码copy下来之后
肯定不能直接打开html页面,浏览器端无法解析3d模型文件,
我刚开始学的时候浏览器不能打开3d文件,各种百度,
遇到说改浏览器后缀名的,改设置的,emmm····没啥用。
其实你只需要开启本地服务器就可以了
步骤截图
输入cmd回车
输入:http-server
在浏览器输入:http://localhost:8080/ 即可(浏览器端显示进去后点击demo文件夹,点击index.html即可)
希望多多支持,我会在下一篇写vue框架如何进行集成这个页面