一篇五分生信临床模型预测文章代码复现——Figure 7 外部数据集验证模型

之前讲过临床模型预测的专栏，但那只是基础版本，下面我们以自噬相关基因为例子，模仿一篇五分文章，将图和代码复现出来，学会本专栏课程，可以具备发一篇五分左右文章的水平：

本专栏目录如下：

Figure 1：差异表达基因及预后基因筛选(图片仅供参考) 

Figure 2. 生存分析，箱线图表达改变分析（图片仅供参考）

Figure 3. 基因富集分析（图片仅供参考） 

Figure 4.构建临床预测模型（图片仅供参考）

Figure 5.训练集训练模型（图片仅供参考）

Figure 6.测试集测试模型（图片仅供参考） 

Figure 7.外部数据集验证模型（图片仅供参考）

Figure 8.生存曲线鲁棒性分析（图片仅供参考）

FIgure 9.列线图构建，ROC分析，DCA分析（图片仅供参考）

Figure 10.机制及肿瘤免疫浸润（图片仅供参考）

Figure 7讲的内容其实和Figure 4-6是一样的，无非就是找一个外部数据库，提取基因和临床信息，然后算risk score，然后做生存曲线，ROC曲线，风险点图和热图，这里我们不再赘述。

以下是我们整理好的外部数据集，如果是做肾癌的小伙伴，可以直接下载使用，