ubuntu安装CD-HIT

法1

首先在官网下载安装包：

我这时候的版本是：cd-hit-v4.8.1-2019-0228.tar.gz

切换到安装包所在目录，执行：

gzip -d cd-hit-v4.8.1-2019-0228.tar.gz
tar -xvf cd-hit-v4.8.1-2019-0228.tar

进入解压好的文件夹，进行编译（make），这里有时候会报错：
In file included from cdhit-common.c++:28:0: cdhit-common.h:39:9: fatal error: zlib.h: No such file or directory #include
这是因为缺少了zlib.h头文件，安装即可：

apt-get install zlib1g-dev

然后再进行编译

再进入cd-hit-auxtools进行编译

执行的时候使用，就可以了，其他参数，查看官网即可
./cd-hit-est-2d -i 输入文件 -o 输出文件

法2

直接用sudo apt-get install cd-hit安装