基因学苑
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nanopore培训视频上线了

经过14的马拉松式的在线直播课程，我们第一期《纳米孔测序数据分析培训班》圆满落幕，通过本次培训学员们充分了解了纳米孔测序相关的问题，并且通过实际操作，能够完成数据数据分析的工作。错过第一期网络课程的，现在可以通过观看我们的在线来进行学习，购买之后可以反复观看学习。

课程介绍

本次推出的视频课程为“纳米孔测序数据分析网络培训班（第1期）”的录播内容，虽然录播内容没有了在线直播的互动性，不过依然是学习纳米孔测序非常好的学习材料。并且视频经过剪辑，去除直播时一些等待操作。每天将近两个小时，14天的直播，视频全长将近25小时，干货满满。通过本视频课程您将学会五大主题内容：

1、深入了解nanopore测序技术；

2、掌握生物信息Linux环境；

3、病原微生物快速鉴定（含新冠病毒数据分析）；

4、拼接一个“完美”的基因组；

5、利用长读长进行SV检测。

日期主题课程安排

6月 1日课程介绍课程介绍

nanopore测序技术简介

nanopore测序技术的应用

6月 2日熟悉工作环境Linux操作基础

6月 3日测序原理测序原理

不同测序平台比较

纳米孔测序的错误问题

6月 4日开始做纳米孔测序nanopore实验室分析平台搭建

6月 5日bioconda使用安装bioconda

利用bioconda管理生物软件

6月 6日软件安装纳米孔测序软件安装

6月 7日前期数据处理HDF5（FAST5）文件格式介绍

利用Guppy进行数据转换

fastq文件格式

数据质控

数据过滤

6月 8日序列比对minimap2序列比对

sam文件格式介绍

samtools处理sam/bam文件

tablet 可视化拼接结果

6月 9日病原微生物快速鉴定纯培养样品鉴定

混合样品鉴定

NCBI物种分类介绍

nt库介绍

nt库下载

blast比对

拆分nt库

构建病毒鉴定数据库

利用MEGAN进行物种鉴定

如何提高比对速度

6月10日新冠病毒数据分析利用纳米孔测序研究新冠病毒

ARTIC Network工作流

6月11日基因组拼接纳米孔测序基因组拼接原理

常用nanopore数据拼接工具

quast组装结果评估

筛选最佳拼接结果 

6月12日混合拼接不同数据混合拼接

illumina测序数据拼接

Pacbio测序数据拼接

二代+三代混合拼接方案

几种拼接方案的比较

BUSCO评估

细菌完成图拼接方案

6月13日拼接完优化组装结果优化原理

利用二代测序优化结果

medaka组装结果纠错

pilon组装结果纠错

racon组装结果纠错

6月14日长片段变异检测利用纳米孔测序检测SNP

利用纳米孔测序检测SV

利用IGV可视化突变结果

如何购买

视频目前已上架腾讯课程，微信登录购买即可观看，课程原价2688元，目前上线促销，领取优惠券，只需半价1344元，优惠券数目有限，三天有效，先到先得。点击“阅读原文”领取优惠。购买之后，联系我们，将获得培训版电子版讲义以及400页培训PPT。

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