原始数据上传NCBI-转录组数据

经常碰到老师在文章接收过程中，编辑要求将原始数据上传NCBI，要是没有数据上传经验的不要慌，小编手把手教你如何快速上传数据至NCBI

（一）NCBI账号：上传数据必须有自己的NCBI账号，2022年以前注册的NCBI账号现在不能直接用了，需要用第三方平台进行验证登录，常用的可以使用windons账号或orcid账号进行登录，小编推荐使用orcid：orcid官网。注册后需要完善个人信息，要不不能上传数据，完善信息按钮如下：

图1 账号完善

（二）进入NCBI主页：NCBI官网，点击Submit

图2 上传按钮

原始数据需要选择上传SRA

图3 选择上传SRA

（三）创建新的submission，开始上传工作

图4 创建新的submission

（1）SUBMITTER，系统自动带出个人账号的信息，可以对信息进行修改

图5 SUBMITTER

（2）General InformationBioProject跟BioSample后续会自动生产，这里不需要提前创建，都选No，发表时间可选 1)上传就释放，2)文章发表或选定日期早出来的那个

图6 general Information

(3)Project Info 数据标题，以及描述信息

图7 Project info

（4）BioSample Type小编这里是植物样本，选择Plant

图8 Biosample Type

(5)Biosample Attributes上传样本信息表，下载Download Excel

图9 Biosample Attributes

样本信息表填写 绿色必须填写，蓝色至少写一列，并且至少一列名称需要不一样，要不后续会报错，小编分享自己通过的模板：

图10 信息表模板

（6）SRA MetaData填写需要上传数据文件，需要下载模板Download Excel spreadsheet

图11 SRA MetaData

小编这里给出自己上传成功的模板，这里的filename需跟上传数据命名一直

图12 SRA数据上传模板

（7）Files，SRA上传，小编强烈推荐使用Aspera 工具进行上传，小编上传速度达到40M/s，比其他方式快几十倍。
下载aspera:地址aspera，选择IBM Aspera Connect，安装后，还需下载图13中的key file，

图13 选择Aspera上传

上传命令：小编Windows系统，首先快捷方式win+r，然后输入cmd，然后根据图13提示，输入命令，例如小编命令：

C:\Users\xutt\AppData\Local\Programs\Aspera\AsperaConnect\bin\ascp.exe -i C:\Users\xutt\AppData\Local\Programs\Aspera\AsperaConnect\bin\aspera.openssh -QT -l100m -k1 -d C:\Users\xutt\Desktop\Data [email protected]:uploads/xutt_cpu.edu.cn_UAATarkk

图14 Windows上传命令

（五）小编后续要是上传重测序数据，或者基因组数据，再更新相关内容，对应转录组数据上传，相信小编写的很详细了。