Pymol 作图、分子对接

提示:文章写完后,目录可以自动生成,如何生成可参考右边的帮助文档

文章目录

  • 前言
  • 一、pymol作图
  • 二、分子对接

  • 总结


前言

Pymol是一款操作简单,功能强大的分子以及蛋白的可视化软件,由薛定谔公司研发,科研人员可以从官网申请最新教育版本,同时pymo的开源版(https://github.com/schrodinger/pymol-open-source),可以直接从网站上下载,但是版本较老。所以,根据需求选择版本进行下载。


提示:以下是本篇文章正文内容,下面案例可供参考

一、pymol是什么?

示例:pandas 是基于NumPy 的一种工具,该工具是为了解决数据分析任务而创建的。

二、使用步骤

2:Pymol 操作

1、内容:导入蛋白,并显示不同的形态。

DEMO:

(1)导入蛋白

a:直接命令行输入

fetch PDBid

b:从PDB下载蛋白文件,从菜单栏file导入

(2)展示蛋白不同形态

2、根据肽序列绘制


 

操作为:

pymol蛋白操作界面,点击字母S,出现的框中,出现上述representation


 

总结

提示:这里对文章进行总结:
例如:以上就是今天要讲的内容,本文仅仅简单介绍了pandas的使用,而pandas提供了大量能使我们快速便捷地处理数据的函数和方法。

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