2021-08-23

《学习小组Day3笔记--高乃林》

直接图文字展示学习过程。

安装软件

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查看list

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安装fastqc软件包

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查看软件包的功能(虽然看不太懂)

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卸载成功

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小插曲:记录一下conda环境是个啥。

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我自己的就是这个


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比如我们要处理转录组数据了,好,先建立一个名叫rnaseq的conda环境,然后指定python版本是3,安装软件fastqc、trimmomatic(这两个可以一步完成)(这里指定python版本是因为有的软件是基于python开发的,不是要你学python或者用它干什么。)

语法:conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y

再看一下我们的conda环境,如下:


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激活语法:conda activate rna-seq

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很明显,*跑到下面的文件夹去了。且前面出现了(rna-seq)的字符(最后一行所示)。

退出

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退出后,前面的(rna-seq)消失了,恢复了原来的模样。

—————End。

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