学习小组Day 6笔记--杨柳松

R包及其说明书（引自生信星球）

下载说明书（俗称小抄）

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tidyr包的功能

1. 数据框的变形
2. 处理数据框中的空值
3. 根据一个表格衍生出其他表格
4. 实现行或列的分割和合并

安装tidyr包

1. 检查是否已安装此包：library(tidyr)
2. 下载与安装tidyr包：在菜单栏→tools→Global Options→Packages界面将镜像设置为国内镜像后，输入命令install.packages("tidyr")
3. 加载tidyr包：library(tidyr)

使用tidyr包

1. 合并列：gather(数据框名,列1原名,列2原名,key = "合并后的列名",value = "此两列数值所对应的新列名")
2. 展开列：spread(数据框名, 列1标题, 列2标题)
3. 删除某列有空白值的行：drop_na(数据框名，列标题)
4. 填充空值：complete(数据框名，nesting(其他列名),fill=list(需要填充的列名="需要填充的内容"))
5. 列出每列值所有可能的组合：expand(数据框名,列名1,列名2,列名3)

练习：打开文件“ui.txt”，将“actin”、“IGF1”两列合并为“基因”，结果定义为“表达量”，合并列后填充空值为0，列出每列值所有可能的组合
代码为：
library(tidyr)
a<-read.csv('ui.txt')
View(a)
b<-gather(a,actin,IGF1,key = "基因",value = "表达量")
View(b)
complete(b,nesting(样品,基因),fill=list(表达量="0"))
c<-complete(b,nesting(样品,基因),fill=list(表达量="0"))
expand(c,样品,基因,表达量)
效果图为：

思维导图：

R包的使用