ImageJ划痕实验分析

一、计算划痕面积

1. file-open:打开要分析的划痕图片

2. Image-Type-8bit

ImageJ划痕实验分析_第1张图片

 3. Process-Enhance Contrase-Smooth-Find Edges 

ImageJ划痕实验分析_第2张图片

 

 

 4. Image-Adjust-Threshold-Apply

下线为0,上限根据情况设为10-30 

ImageJ划痕实验分析_第3张图片

 5. 魔棒工具选择目标区域

ImageJ划痕实验分析_第4张图片

 6. Analyze-Measure即可计算出目标区域的像素面积 

ImageJ划痕实验分析_第5张图片

二、将划痕的标记线添加至原图

1. Analyze-Tools-ROI Manager 

ImageJ划痕实验分析_第6张图片

2. 依次点击Add-Show All 

ImageJ划痕实验分析_第7张图片

3. 修改标记线颜色或线宽,ROI Manager中点击Properties,Color和Width中修改颜色和线宽 

ImageJ划痕实验分析_第8张图片

ImageJ划痕实验分析_第9张图片

4. 重新打开原图Image-Overlay-From ROI Manager

ps:示例而已,图非常难看,重在参考 

ImageJ划痕实验分析_第10张图片

 三、保存图片

1. Image-Overlay-Flatten

创建原始数据的一个副本,这个副本改变了原有数据的格式,变成了一个标准RGB格式的图片

ImageJ划痕实验分析_第11张图片

 2. 选中图片,File-Save或Save As,重新打开就有标记了

ImageJ划痕实验分析_第12张图片

你可能感兴趣的:(实验&分析,生物信息学)