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摘要:本文主要介绍了Python在生物信息学中的应用,特别是在基因组学和蛋白质组学领域。文章详细讲述了各个原理,并以代码实例展示了实际应用。我们将探讨如何利用Python分析基因组数据,解析蛋白质序列,以及进行比对分析等。文章目录1.引言2.分析基因组数据2.1读取和解析FASTA文件2.2基因频率分析2.3代码实例3.蛋白质组学3.1解析蛋白质序列3.2蛋白质序列比对3.3代码实例4.总结1.引
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今天学习了循环结构,其实说心里话,不是太明白,尤其是老师讲了那些高深的理论之后,就更加糊涂了。后来还是借助deepseek,它说:循环结构就是让计算机重复执行某段代码,直到满足特定条件(比如吃饱了就停止吃饭)。吃饱了就停止吃饭,多么简单的一句话,我一下就明白了,忽然觉得那些讲课喜欢高深理论的人,他们真的好可悲。总是抱着概念和教条的东西,不知道你们是怎么听明白的。循环结构的三种常见类型是`for循环
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C#笔试题一、基础知识OOP的基本概念面向对象编程的核心思想包括四个主要特性:继承、多态、封装和信息隐藏。请简述这四个特性的具体内容。值类型与引用类型的区别值类型(如int,string)在内存中直接存储数据,而引用类型(如object,ref)通过引用间接存储,指出值的位置。请举例说明两者的不同。静态与非静态关键字的作用静态和非静态关键字用于区分依赖于实例还是不依赖于实例的成员。请分别解释它们的
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Lumberyard:Lumberyard物理系统详解Lumberyard物理系统概述物理引擎介绍Lumberyard,亚马逊的游戏引擎,集成了强大的物理引擎,用于模拟游戏世界中的真实物理行为。其物理引擎基于PhysX,一个由NVIDIA开发的物理模拟技术,广泛应用于游戏开发中。PhysX支持复杂的物理交互,包括刚体动力学、软体物理、流体动力学等,能够为游戏提供逼真的物理效果。物理系统在Lumbe
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当矩阵的非零元个数与位置在操作中变化较大时,就不宜用顺序存储结构来表示三元组的线性表。在链表中,每个非零元可用一个含5个域的结点表示,其中i,j,e这三个域分别表示该非零元所在的行的值,向右域right用以链接同一行中下一个非零元,向下域down用以链接同一列中下一个非零元,向右域right用以链接同一行中下一个非零元,向下域down用以链接同一列中下一个非零元。同一行的非零元通过right域链接
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COMMIT功能描述提交当前事务。语法格式COMMIT[WORK|TRANSACTION]参数说明WORK|TRANSACTION:可选的关键词,没有具体效果。注意事项执行COMMIT这个命令的时候,命令执行者必须是该事务的创建者或系统管理员,且创建和提交操作可以不在同一个会话中。语法兼容符合SQL标准。相关语法BEGIN,ROLLBACK,ENDCOMMITPREPARED功能描述提交一个预先为
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ALTERINDEX功能描述修改一个索引的参数。语法格式ALTERINDEX[IFEXISTS]nameRENAMETOnew_nameALTERINDEX[IFEXISTS]nameSETTABLESPACEtablespace_nameALTERINDEXnameDEPENDSONEXTENSIONextension_nameALTERINDEX[IFEXISTS]nameSET(storag
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Java流程控制用户交互Scannerjava.util.Scanner使用这个包中Scanner类获取用户的输出基本语法 Scanners=newScanner(System.in);通过Scanner类的next()与nextLine()方法获取输入的字符串,在读取前我们要使用hasNext()与hasNextLine()判断用户是否还有输入的数据next():一定要读取到有效字符后才可以结束
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摘要旗鱼优化算法(SailfishOptimizer,SFO)是一种模拟旗鱼(Sailfish)和沙丁鱼(Sardine)之间捕食关系的新型元启发式算法。通过在搜索过程中模拟旗鱼对沙丁鱼的捕食行为,以及沙丁鱼群的逃逸与防御机制,SFO平衡了全局探索与局部开发,在处理复杂优化问题时具有良好的收敛性能。本文提供了SFO的核心思路并提供了完整MATLAB代码及详细中文注释,以帮助读者快速理解并应用该算法
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C#—线程池详解核心机制说明自动回收与重用线程池中的线程在完成任务后不会销毁,而是回到池中等待新任务。无需手动“重新启用”,线程池会自动调度可用线程处理新任务。线程回收策略空闲线程超过一定时间(默认约20秒)后会被自动回收突发大量任务时,线程池会按需创建新线程(受SetMinThreads/SetMaxThreads限制)线程池概述线程池(ThreadPool)是.NET提供的一种线程管理机制,通
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可以使用Collections.sort()方法对JavaList按照某个字段排序。假设有一个名为personList的List,其中的元素为Person对象,Person对象的某个字段为age,可以按照age字段来排序。第一种方法是通过实现Comparator接口来定义排序规则,然后使用Collections.sort()方法进行排序:publicclassPersonComparatorimp
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根据GithubTrendings的统计,本周(2025-03-10统计)共有13个项目上榜。根据开发语言中项目的数量,汇总情况如下:开发语言项目数量Python项目7TypeScript项目2JavaScript项目2C++项目1JupyterNotebook项目1Vue项目1文档项目1Rust项目1Svelte项目1从零开始构建你喜爱的技术创建周期:2156天Star数量:253338个For
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挂载GitHubPages的方法基本步骤创建仓库:在GitHub上创建一个新的仓库。如果使用自定义域名,则仓库名应为.github.io;否则可以是任意名称。启用GitHubPages:进入仓库的设置页面,在“Pages”部分选择要发布的分支(通常是main或master),然后保存更改。上传网站内容:将你的HTML、CSS、JavaScript等文件上传到仓库中指定的分支。什么是SSHSSH是一
- 2021-06-04 VSC++:数组移位。
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本实例是真正的O(N)不是有些需要最坏O(2N)才能完成的却硬称O(N)本例在数组中是已经完全完成了的。void数组移位(){//缘由https://ask.csdn.net/questions/7441793?spm=1005.2025.3001.5141inta[47]{},*aa,n=0,p=0,x=0;aa=a;//时空复杂度O(N)std::cin>>n>>p;while(x>a[x++
- Harmony------应用程序框架
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1.应该程序框架基础多Module设计机制模块化开发:一个应用多个功能,每个功能可作为一个模块,Module中可以包含源代码、资源文件、第三方库、配置文件等,每一个Module可以独立编译,实现特定的功能支持多设备:每个Module都会标注所支持的设备类型,可以根据需要组合Module类型ability类型的module:用于实现应用的功能和特性,每个ability类型的module编译后,会生成
- Oracle-表空间/用户的创建与使用
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--对象--需要create的都是对象已学的对象:表table--普通用户只能查询user开头的数据字典selecttablespace_namefromuser_tablespaces;--dba用户才能够查询selecttablespace_namefromdba_tablespaces;--创建表空间(需要管理员权限dba用户)--语法解释CREATETABLESPACEts_test--表
- 遍历dom 并且存储(将每一层的DOM元素存在数组中)
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数组从0开始!!
var a=[],i=0;
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a[j]=[];//数组里套数组,且第i层存储在第a[i]中
}
function walkDOM(n){
do{
if(n.nodeType!==3)//筛选去除#text类型
a[i].push(n);
//con
- Android+Jquery Mobile学习系列(9)-总结和代码分享
白糖_
JQuery Mobile
目录导航
经过一个多月的边学习边练手,学会了Android基于Web开发的毛皮,其实开发过程中用Android原生API不是很多,更多的是HTML/Javascript/Css。
个人觉得基于WebView的Jquery Mobile开发有以下优点:
1、对于刚从Java Web转型过来的同学非常适合,只要懂得HTML开发就可以上手做事。
2、jquerym
- impala参考资料
dayutianfei
impala
记录一些有用的Impala资料
1. 入门资料
>>官网翻译:
http://my.oschina.net/weiqingbin/blog?catalog=423691
2. 实用进阶
>>代码&架构分析:
Impala/Hive现状分析与前景展望:http
- JAVA 静态变量与非静态变量初始化顺序之新解
周凡杨
java静态非静态顺序
今天和同事争论一问题,关于静态变量与非静态变量的初始化顺序,谁先谁后,最终想整理出来!测试代码:
import java.util.Map;
public class T {
public static T t = new T();
private Map map = new HashMap();
public T(){
System.out.println(&quo
- 跳出iframe返回外层页面
g21121
iframe
在web开发过程中难免要用到iframe,但当连接超时或跳转到公共页面时就会出现超时页面显示在iframe中,这时我们就需要跳出这个iframe到达一个公共页面去。
首先跳转到一个中间页,这个页面用于判断是否在iframe中,在页面加载的过程中调用如下代码:
<script type="text/javascript">
//<!--
function
- JAVA多线程监听JMS、MQ队列
510888780
java多线程
背景:消息队列中有非常多的消息需要处理,并且监听器onMessage()方法中的业务逻辑也相对比较复杂,为了加快队列消息的读取、处理速度。可以通过加快读取速度和加快处理速度来考虑。因此从这两个方面都使用多线程来处理。对于消息处理的业务处理逻辑用线程池来做。对于加快消息监听读取速度可以使用1.使用多个监听器监听一个队列;2.使用一个监听器开启多线程监听。
对于上面提到的方法2使用一个监听器开启多线
- 第一个SpringMvc例子
布衣凌宇
spring mvc
第一步:导入需要的包;
第二步:配置web.xml文件
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<web-app version="2.5"
xmlns="http://java.sun.com/xml/ns/javaee"
xmlns:xsi=
- 我的spring学习笔记15-容器扩展点之PropertyOverrideConfigurer
aijuans
Spring3
PropertyOverrideConfigurer类似于PropertyPlaceholderConfigurer,但是与后者相比,前者对于bean属性可以有缺省值或者根本没有值。也就是说如果properties文件中没有某个bean属性的内容,那么将使用上下文(配置的xml文件)中相应定义的值。如果properties文件中有bean属性的内容,那么就用properties文件中的值来代替上下
- 通过XSD验证XML
antlove
xmlschemaxsdvalidationSchemaFactory
1. XmlValidation.java
package xml.validation;
import java.io.InputStream;
import javax.xml.XMLConstants;
import javax.xml.transform.stream.StreamSource;
import javax.xml.validation.Schem
- 文本流与字符集
百合不是茶
PrintWrite()的使用字符集名字 别名获取
文本数据的输入输出;
输入;数据流,缓冲流
输出;介绍向文本打印格式化的输出PrintWrite();
package 文本流;
import java.io.FileNotFound
- ibatis模糊查询sqlmap-mapping-**.xml配置
bijian1013
ibatis
正常我们写ibatis的sqlmap-mapping-*.xml文件时,传入的参数都用##标识,如下所示:
<resultMap id="personInfo" class="com.bijian.study.dto.PersonDTO">
<res
- java jvm常用命令工具——jdb命令(The Java Debugger)
bijian1013
javajvmjdb
用来对core文件和正在运行的Java进程进行实时地调试,里面包含了丰富的命令帮助您进行调试,它的功能和Sun studio里面所带的dbx非常相似,但 jdb是专门用来针对Java应用程序的。
现在应该说日常的开发中很少用到JDB了,因为现在的IDE已经帮我们封装好了,如使用ECLI
- 【Spring框架二】Spring常用注解之Component、Repository、Service和Controller注解
bit1129
controller
在Spring常用注解第一步部分【Spring框架一】Spring常用注解之Autowired和Resource注解(http://bit1129.iteye.com/blog/2114084)中介绍了Autowired和Resource两个注解的功能,它们用于将依赖根据名称或者类型进行自动的注入,这简化了在XML中,依赖注入部分的XML的编写,但是UserDao和UserService两个bea
- cxf wsdl2java生成代码super出错,构造函数不匹配
bitray
super
由于过去对于soap协议的cxf接触的不是很多,所以遇到了也是迷糊了一会.后来经过查找资料才得以解决. 初始原因一般是由于jaxws2.2规范和jdk6及以上不兼容导致的.所以要强制降为jaxws2.1进行编译生成.我们需要少量的修改:
我们原来的代码
wsdl2java com.test.xxx -client http://.....
修改后的代
- 动态页面正文部分中文乱码排障一例
ronin47
公司网站一部分动态页面,早先使用apache+resin的架构运行,考虑到高并发访问下的响应性能问题,在前不久逐步开始用nginx替换掉了apache。 不过随后发现了一个问题,随意进入某一有分页的网页,第一页是正常的(因为静态化过了);点“下一页”,出来的页面两边正常,中间部分的标题、关键字等也正常,唯独每个标题下的正文无法正常显示。 因为有做过系统调整,所以第一反应就是新上
- java-54- 调整数组顺序使奇数位于偶数前面
bylijinnan
java
import java.util.Arrays;
import java.util.Random;
import ljn.help.Helper;
public class OddBeforeEven {
/**
* Q 54 调整数组顺序使奇数位于偶数前面
* 输入一个整数数组,调整数组中数字的顺序,使得所有奇数位于数组的前半部分,所有偶数位于数组的后半
- 从100PV到1亿级PV网站架构演变
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网站架构
一个网站就像一个人,存在一个从小到大的过程。养一个网站和养一个人一样,不同时期需要不同的方法,不同的方法下有共同的原则。本文结合我自已14年网站人的经历记录一些架构演变中的体会。 1:积累是必不可少的
架构师不是一天练成的。
1999年,我作了一个个人主页,在学校内的虚拟空间,参加了一次主页大赛,几个DREAMWEAVER的页面,几个TABLE作布局,一个DB连接,几行PHP的代码嵌入在HTM
- [宇宙时代]宇宙时代的GIS是什么?
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我们都知道一个事实,在行星内部的时候,因为地理信息的坐标都是相对固定的,所以我们获取一组GIS数据之后,就可以存储到硬盘中,长久使用。。。但是,请注意,这种经验在宇宙时代是不能够被继续使用的
宇宙是一个高维时空
- 详解create database命令
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database
完整命令
CREATE DATABASE mynewdb USER SYS IDENTIFIED BY sys_password USER SYSTEM IDENTIFIED BY system_password LOGFILE GROUP 1 ('/u01/logs/my/redo01a.log','/u02/logs/m
- 几句不中听却不得不认可的话
datageek
1、人丑就该多读书。
2、你不快乐是因为:你可以像猪一样懒,却无法像只猪一样懒得心安理得。
3、如果你太在意别人的看法,那么你的生活将变成一件裤衩,别人放什么屁,你都得接着。
4、你的问题主要在于:读书不多而买书太多,读书太少又特爱思考,还他妈话痨。
5、与禽兽搏斗的三种结局:(1)、赢了,比禽兽还禽兽。(2)、输了,禽兽不如。(3)、平了,跟禽兽没两样。结论:选择正确的对手很重要。
6
- 1 14:00 PHP中的“syntax error, unexpected T_PAAMAYIM_NEKUDOTAYIM”错误
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PHP
原文地址:http://www.kafka0102.com/2010/08/281.html
因为需要,今天晚些在本机使用PHP做些测试,PHP脚本依赖了一堆我也不清楚做什么用的库。结果一跑起来,就报出类似下面的错误:“Parse error: syntax error, unexpected T_PAAMAYIM_NEKUDOTAYIM in /home/kafka/test/
- xcode6 Auto layout and size classes
dcj3sjt126com
ios
官方GUI
https://developer.apple.com/library/ios/documentation/UserExperience/Conceptual/AutolayoutPG/Introduction/Introduction.html
iOS中使用自动布局(一)
http://www.cocoachina.com/ind
- 通过PreparedStatement批量执行sql语句【sql语句相同,值不同】
梦见x光
sql事务批量执行
比如说:我有一个List需要添加到数据库中,那么我该如何通过PreparedStatement来操作呢?
public void addCustomerByCommit(Connection conn , List<Customer> customerList)
{
String sql = "inseret into customer(id
- 程序员必知必会----linux常用命令之十【系统相关】
hanqunfeng
Linux常用命令
一.linux快捷键
Ctrl+C : 终止当前命令
Ctrl+S : 暂停屏幕输出
Ctrl+Q : 恢复屏幕输出
Ctrl+U : 删除当前行光标前的所有字符
Ctrl+Z : 挂起当前正在执行的进程
Ctrl+L : 清除终端屏幕,相当于clear
二.终端命令
clear : 清除终端屏幕
reset : 重置视窗,当屏幕编码混乱时使用
time com
- NGINX
IXHONG
nginx
pcre 编译安装 nginx
conf/vhost/test.conf
upstream admin {
server 127.0.0.1:8080;
}
server {
listen 80;
&
- 设计模式--工厂模式
kerryg
设计模式
工厂方式模式分为三种:
1、普通工厂模式:建立一个工厂类,对实现了同一个接口的一些类进行实例的创建。
2、多个工厂方法的模式:就是对普通工厂方法模式的改进,在普通工厂方法模式中,如果传递的字符串出错,则不能正确创建对象,而多个工厂方法模式就是提供多个工厂方法,分别创建对象。
3、静态工厂方法模式:就是将上面的多个工厂方法模式里的方法置为静态,
- Spring InitializingBean/init-method和DisposableBean/destroy-method
mx_xiehd
javaspringbeanxml
1.initializingBean/init-method
实现org.springframework.beans.factory.InitializingBean接口允许一个bean在它的所有必须属性被BeanFactory设置后,来执行初始化的工作,InitialzingBean仅仅指定了一个方法。
通常InitializingBean接口的使用是能够被避免的,(不鼓励使用,因为没有必要
- 解决Centos下vim粘贴内容格式混乱问题
qindongliang1922
centosvim
有时候,我们在向vim打开的一个xml,或者任意文件中,拷贝粘贴的代码时,格式莫名其毛的就混乱了,然后自己一个个再重新,把格式排列好,非常耗时,而且很不爽,那么有没有办法避免呢? 答案是肯定的,设置下缩进格式就可以了,非常简单: 在用户的根目录下 直接vi ~/.vimrc文件 然后将set pastetoggle=<F9> 写入这个文件中,保存退出,重新登录,
- netty大并发请求问题
tianzhihehe
netty
多线程并发使用同一个channel
java.nio.BufferOverflowException: null
at java.nio.HeapByteBuffer.put(HeapByteBuffer.java:183) ~[na:1.7.0_60-ea]
at java.nio.ByteBuffer.put(ByteBuffer.java:832) ~[na:1.7.0_60-ea]
- Hadoop NameNode单点问题解决方案之一 AvatarNode
wyz2009107220
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我们遇到的情况
Hadoop NameNode存在单点问题。这个问题会影响分布式平台24*7运行。先说说我们的情况吧。
我们的团队负责管理一个1200节点的集群(总大小12PB),目前是运行版本为Hadoop 0.20,transaction logs写入一个共享的NFS filer(注:NetApp NFS Filer)。
经常遇到需要中断服务的问题是给hadoop打补丁。 DataNod