最基础的形态学操作有四个,分别是腐蚀、膨胀、开计算和闭计算,`scipy.ndimage分别实现了二值数组和灰度数组的这四种运算
二值 | 灰度 | |
---|---|---|
binary_erosion |
grey_erosion |
腐蚀 |
binary_dilation |
grey_dilation |
膨胀 |
binary_closing |
grey_closing |
闭(先膨胀后腐蚀) |
binary_opening |
grey_opening |
开(先腐蚀后膨胀) |
所谓腐蚀,用数学符号表示为
A ⊖ B = { ( i , j ) ∣ B i j ⊆ A } A\ominus B=\{(i,j)|B_{ij}\subseteq A\} A⊖B={(i,j)∣Bij⊆A}
其中 B i j B_{ij} Bij表示当 B B B的原点在 ( i , j ) (i,j) (i,j)处时,B中所有为1的值的集合。
这个式子的意思是,用结构B腐蚀A,当B的原点平移到图像A的像元 ( i , j ) (i,j) (i,j)时,若B完全被二者的重叠区域所包围,则赋值为1,否则赋值为0。更直观的例子是,如果B中为1的元素位置上,对应的A的像素值也都为1,则 ( i , j ) (i,j) (i,j)处为1。
膨胀则与之相反,可表示为
A ⊕ B = { ( i , j ) ∣ B i j ∪ A ≠ ∅ } A\oplus B=\{(i,j)|B_{ij}\cup A\not=\varnothing\} A⊕B={(i,j)∣Bij∪A=∅}
换言之,只要 B B B和 A A A的重叠区域不是空集,那么 ( i , j ) (i,j) (i,j)点就置为1。
举个例子如下
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import scipy.ndimage as sn
x = np.zeros([20,20])
x[5:15, 5:15] = 1
x_ero = sn.binary_erosion(x)
x_dil = sn.binary_dilation(x)
fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(1,3,1)
ax.imshow(x)
plt.title("original")
ax = fig.add_subplot(1,3,2)
ax.imshow(x_ero)
plt.title("erosion")
ax = fig.add_subplot(1,3,3)
ax.imshow(x_dil)
plt.title("dilation")
plt.show()
效果如下
开运算是先腐蚀后膨胀;闭运算是先膨胀后腐蚀,示例如下
x = np.zeros([20,20])
x[5:15, 5:15] = 1
x[10:12,10:12] = 0
x[2:4, 2:4] = 1
x_open = sn.binary_opening(x)
x_close = sn.binary_closing(x)
fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(1,3,1)
ax.imshow(x)
plt.title("original")
ax = fig.add_subplot(1,3,2)
ax.imshow(x_open)
plt.title("opening")
ax = fig.add_subplot(1,3,3)
ax.imshow(x_close)
plt.title("closing")
plt.show()
效果如下,可见开运算会去除孤立的1,闭运算会去除孤立的0。
灰度图像的腐蚀、膨胀以及开闭运算,是其二值形势下的一个扩展,采用了类似卷积的逻辑,下面直接从scipy
中调取楼梯图片,并依次做腐蚀、膨胀以及开闭操作。
from scipy.misc import ascent
img = ascent()
funcs = {
"original": lambda x, tmp:x,
"erosion" : sn.grey_erosion,
"dilation" : sn.grey_dilation,
"opening" : sn.grey_opening,
"closing" : sn.grey_closing
}
fig = plt.figure()
for i, key in enumerate(funcs):
ax = fig.add_subplot(2,3,i+1)
plt.imshow(funcs[key](img, (10,10)), cmap=plt.cm.gray)
plt.title(key)
plt.show()
效果如下
参数列表
二值函数和灰度函数的参数并不相同,下面以closing
运算为例,二值和灰度函数的所有参数,除了输入input
之外,二者共有的参数有
structure
为数组类型,表示构造元素,可以理解为是卷积模板output
与输入相同维度的数组,可以存下结果orgin
过滤器设置,默认为0二值形态学滤波的其他参数如下
binary_closing(input, iterations=1, mask=None, border_value=0, brute_force=False)
其中
iterations
执行次数mask
掩模数组,为bool类型的数组,对应False
的位置将不会改变border_value
边缘处的值brute_force
如果为False
,则只有上次迭代中发生变化的值才会更新grey_closing(input, size=None, footprint=None, mode='reflect', cval=0.0)
size
为滤波模板mode
可选reflect,constant,nearest,mirror, wrap
,边缘填充方式cval
边缘填充值