前言
本文主要基于MySQL 5.6以后版本编写，多数知识来着书籍《MySQL技术内幕++InnoDB存储引擎》，本文章仅记录个人认为比较重要的部分，有兴趣的可以花点时间读原书。
一、MySQL体系结构
主要包含以下几部分：
1、管理服务于工具组件。
2、连接池与鉴权。
3、SQL接口。
4、查询分析器。
5、优化器组件。
6、缓存与缓冲区。
7、各式的插件式存储引擎。
8、物理文件。
其中存储引擎是基于表，而非数据库。
二、InnoDB体系结构
InnoDB引擎包含几个重要部分:
1、后台进程：
1.1 Master Thread：核心线程，负责缓冲池的数据异步入盘，包括脏页刷新、合并插入缓冲、undo页回收等。
1.2 IO Thread：包括read thread 和writer thread，使用show variables like '%innodb_%io_thread%';查看。
1.3 Purge Thread：回收事务提交后不再需要的undo log，通过show variables like '%innodb_purge_threads%'; 查看。
1.4 Page clear thread：脏页的刷新操作，从master thread分离出来。
2、内存池
2.1 缓冲池
InnoDB将记录按页的形式进行管理，对于页的修改先修改缓冲池中的页，后以一定频率进行刷新到磁盘中（checkpoint）。在数据库的页读取操作时，将也缓存到缓冲池中，下一次如读取相同的页，则无需从磁盘中加载。缓存池大小通过innodb_buffer_pool_size配置。
从上图来看，主要包括索引页、数据页、undo页、insert buffer、adaptive hash index、数据字典等，其中索引页和数据页占用多数内存。
配置innodb_pool_buffer_instances将缓冲池分割为多个实例，减少内部竞争(比如锁)。
2.2 LRU list、free list、flush list
默认的缓冲页大小是16KB，使用LRU算法进行管理，新从磁盘加载的页默认加到LRU列表的midpoint处（尾端算起37%位置处）。通过show engine innodb status输出如下（部分）：
-------------------
Buffer pool size 512 【缓冲池内存512*16K】
Free buffers 256
Database pages 256 【LRU列表占用页】
Old database pages 0
Modified db pages 0
Pending reads 0
Pending writes: LRU 0, flush list 0, single page 0
Pages made young 0, not young 0
0.00 youngs/s, 0.00 non-youngs/s
Pages read 255, created 40, written 67
0.16 reads/s, 0.06 creates/s, 0.37 writes/s
Buffer pool hit rate 943 / 1000 【缓冲池命中率大于95%则良好】, young-making rate 0 / 1000 not 0 / 1000
LRU len: 256, unzip_LRU len: 0 【LRU列表中的页可被压缩分为1K/2K/4K/8K之类的页】
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LRU列表中的页被修改后变为dirty page，此时缓冲池中的页和磁盘不一致，通过checkpoint刷回磁盘，其中Flush list即为dirty page列表。
2.3 Redo log buffer
InnoDB将重做日志首先刷入缓冲区中，后续以每秒一次刷新到日志文件中，通过show variables like 'innodb_log_buffer_size'; 查看，需要保证mysql每秒事务量应该小于此大小，通常可以配置8-32MB。以下情况会刷新缓冲区到磁盘的重做日志文件中：
1、Master thread每秒刷新。
2、每个事务提交。
3、缓冲区空间小于1/2（如果缓冲区过小则导致频繁的磁盘刷新，降低性能）。
2.4 innodb_additonal_mem_pool_size
如果申请了很大的buffer pool，此参数应该相应增加，存储了LRU、锁等信息。
3、checkpoint
每次执行update、delete等语句更改记录时，缓冲池中的页与磁盘不一致，但是缓冲池的页不能频繁刷新到磁盘中（频率过大性能低），因此增加了write ahead log策略，当事务提交时先写重做日志，再修改内存页。当发生宕机时通过重做日志来恢复。checkpint解决以下问题：
（1）减少重做日志大小，缩减数据恢复时间。
（2）缓冲池不够用时将脏页刷回磁盘。
（3）重做日志不可用时将脏页刷回磁盘（如写满）。
show variables like 'innodb_max_dirty_pages_pct'; (默认75%)来控制inndodb强制进行checkpoint。
若每个重做日志大小为1G，定了了两个总共2G，则：
asyn_water_mark = 75 % * 重做日志总大小。
syn_water_mark = 90 % * 重做日志总大小。
（1）当checkpoint_age <asyn_water_mark时则不需要刷新脏页回盘。
（2）当syn_water_mark < checkpoint_age <syn_water_mark 时触发ASYNC FLUSH。
（3）当checkpoint_age>syn_water_mark触发sync flush，此情况很少发生，一般出现在大量load data或bulk insert时。
4、InnoDB关键特性
关键特性包括：
(1) Insert buffer.
(2) double write.
(3) adaptive hash index.
(4) Async IO.
(5)Flush neighbor page.
4.1 Insert buffer
若插入按照聚集索引primary key插入，页中的行记录按照primary存放，一般情况下不需要读取另一个页记录，插入速度很快（如果使用UUID或者指定的ID插入而非自增类型则可能导致非连续插入导致性能下降，由B+树特性决定）。如果按照非聚集索引插入就很有可能存在大量的离散插入，insert buffer对于非聚集索引的插入和更新操作进行一定频率的合并操作，再merge到真正的索引页中。使用insert buffer需满足条件：
（1）索引为辅助索引。
（2）索引非唯一。（唯一索引需要从查找索引页中的唯一性，可能导致离散读取）
4.2 Double write
Doubel write保证了页的可靠性，Redo log是记录对页(16K)的物理操作，若innodb将页写回表时写了一部分(如4K)出现宕机，则物理页将会损坏无法通过redolog恢复。所以在apply重做日志前，将缓冲池中的脏页通过memcpy到doublewrite buffer中，再将doublewrite buffer页分两次每次1MB刷入共享表空间的磁盘文件中（磁盘连续，开销较小），完成doublewrite buffer的页写入后再写入各个表空间的表中。
当写入页时发生系统崩溃，恢复过程中，innodb从共享表空间的doublewrite找到该页的副本，并将其恢复到表空间文件中，再apply重做日志。
4.3 Adaptive hash index
Innodb根据访问频率对热点页建立哈希索引，AHI的要求是对页面的访问模式必须一样，如连续使用where a='xxx' 访问了100次。建立热点哈希后读取速度可能能提升两倍，辅助索引连接性能提升5倍。
通过show engine innodb status\G;查看hash searches/s, 表示使用自适应哈希，对于范围查找则不能使用。
4.4 Async IO
用户执行一次扫描如果需要查询多个索引页，可能会执行多个IO操作，AIO可同时发起多个IO请求，系统自动将这些IO请求合并（如请求数据页[1，2]、[2,3]则可合并为从1开始连续扫描3个页）提高读取性能。
4.5 刷新临近页
InnoDB提供刷新临近页功能：当刷新一脏页时，同时检测所在区(extent)的所有页，如果有脏页则一并刷新，好处则是通过AIO特性合并写IO请求，缺点则是有些页不怎么脏也好被刷新，而且频繁的更改那些不怎么脏的页又很快变成脏页，造成频繁刷新。对于固态磁盘则考虑关闭此功能（将innodb_flush_neighbors设置为0）。
5、InnoDB的启动、关闭与恢复
5.1 innodb_fast_shutdown
该值影响数据库正常关闭时的行为，取值可以为0/1/2（默认为1）：
【为0时】：关闭过程中需要完成所有的full purge好merge insert buffer，并将所有的脏页刷新回磁盘，这个过程可能需要一定的时间，如果是升级InnoDB则必须将此参数调整为0再关闭数据库。
【为1时(默认)】：不需要full purge和merge insert buffer，但会将缓冲池中的脏页写回磁盘。
【为2时】：不需要full purge和merge insert buffer，也不会将缓冲池中的脏页写回磁盘，而是将日志写入日志文件中，后续启动时recovery。
5.2 innodb_force_recovery
参数innodb_force_recovery直接影响InnoDB的恢复情况。
默认值为0：进行所有的恢复操作，当不能进行有效恢复（如数据页corrupt）则将错误写入错误日志中。
某些情况下不需要完整的恢复造成，则可定制恢复策略，有以下几种：
1（SRV_FORCE_IGNORE_CORRUPT）：忽略检查到的corrupt页。
2（SRV_FORCE_NO_BACKGROUND）：阻止Master Thread线程运行，如果master thread需要进行full purge操作，这样会导致crash。
3（SRV_FORACE_NO_TRX_UNDO）:不进行事务的回滚操作。
4（SRV_FORCE_NO_IBUF_MERGE）:不进行插入缓冲区的合并操作。
5（SRV_FORCE_NO_UNDO_LOG_SCAN）:不查看undo log，这样未提交的事务被视为已提交。
6（SRV_FORCE_NO_LOG_REDO）:不进行redo操作。
在设置了innodb_force_recovery大于0后可对表进行select/create/drop操作，但不能进行insert update和delete等DML。如有大事务未提交，并且发生了宕机，恢复过程缓慢，不需要进行事务回滚则将参数设置为3以加快启动过程。
三、文件
3.1 二进制日志
二进制日志记录MySQL的变更操作(不包含查询)，如果数据的影响行数为0也会记录。主要用于数据的恢复、复制、审计等场景。通过log-bin参数配置binlog的文件名。影响二进制日志记录的行为有：
(1) max_binglog_size
(2) binlog_cache_size
(3) sync_binlog
(4) binlog-to-db
(5) binlog-ignore-db
(6) log-slave-update
(7) binlog_format
max_binglog_size指定单个日志文件最大值，超过则产生新文件，默认为1G。
binlog_cache_size默认为32K，记录未提交的事务，当提交事务后会写入二进制日志文件中，该参数是基于会话的，不宜设置过大，通过以下命令检查是否cache不够导致使用到了磁盘(binlog_cache_disk_use)，单位为次数：
$ show variables like 'binlog_cache_size';
$ show global status like 'binlog_cache%'; （该命令显示的单位为次数）
如果显示的binlog_cache_disk_use次数较多，则考虑要增加binlog_cache_size大小。
sync_binlog表示每写多少次缓冲就同步到磁盘，通过设置参数为1则代表同步的方式写磁盘，但即使将该参数设置为1，还有一种异常场景：假设事务发出commit前，由于sync_binlog设置为1会立即写盘，但实际上还没提交事务就宕机，下次重启前由于没有commit动作事务将会被回滚，但二进制日志记录了该事务又不能被回滚，该异常场景通过设置innodb_support_xa为1来解决，保证了二进制日志与InnoDB存储赢钱数据文件的同步。
3.2 InnoDB存储引擎文件
3.2.1 表空间文件
默认共享表空间为ibatat1，可通过设定innodb_data_file_path=/db/ibdata1:2000M; /dir2/db/ibdata2:2000M:autoextend 指定多个共享表空间文件(用于均衡磁盘负载)，通过设置autoextend用完自动增长，该文件不会缩小（即使删除记录），只能通过导出数据后，再删除该文件后重启再导入才能缩小此文件占用的空间。
一般情况下开启参数innodb_file_per_table=ON来开个独立表空间，每个表都有自己的表空间，以：表名.idb 命名，在清空表会后自动释放此单独的表空间。
独立的表空间仅存储该表的数据、索引、插入缓冲BITMAP等信息，其余的信息还是放在默认表空间中。
3.2.2 重做日志文件(Redo log file)
MySQL默认初始化ib_logfile0、ib_logfile1两个重做日志文件，一个用完切换到另一个，影响参数如下：
(1) innodb_log_file_size : 每个redo log文件大小。
innodb_log_files_in_group : 文件组中的文件数量，默认为2.
innodb_mirrored_log_groups : 镜像文件组数量，默认为1，如果磁盘已做高可用阵列，则用默认的1即可，不再需要再做日志镜像。
innodb_log_group_home_dir : 日志文件路径，默认在数据文件路径下。
Redo log设置不易过大，多大则重启需要恢复时间很长，也不宜过小，过小则导致频繁发生async checkpoint，需要刷脏页回磁盘，影响性能。一般的应用设置为1G即可。
InnoDB中重做日志是记录每个page的物理更改情况，而二进制文件是仅在事务提交前提交(即只写磁盘一次)，在事务进行过程中，却不断有redo entry写入到重做日志文件中。两者是由差别的。
参数innodb_flush_log_at_trx_commit影响重做日志的刷写动作，有以下值：
【0】事务提交时并不写，而是等待主线程每秒刷写一次。
【1】默认值，表示执行事务commit时同步写到磁盘，提供最大的安全性，也是最慢的方式。
【2】异步写磁盘，先写到系统缓存，交给系统写到磁盘。
四、表
表空间由segment、extend、page组成，其中page是InnoDB磁盘管理的最小单位(默认大小为16K)。如下图：
如果启用了innodb_file_per_table参数，每张表的表空间只存放数据、所以和插入缓冲bitmap页，其他的数据如undo信息、插入缓冲、double write buffer等还是存放在共享表空间中。
4.1 Segment (段)
常见的segment有数据段、索引段、回滚段等， 数据段为 B+树的叶子节点(Leaf node segment)、索引段为B+树的非叶子节点(Non-leaf node segment)。如下图：
4.2 Extend (区)
每个区大小固定为1MB，为保证区中page的连续性通常InnoDB会一次从磁盘中申请4-5个区。在默认page的大小为16KB的情况下，一个区则由64个连续的page。
InnoDB 1.2.x版本增加参数innodb_page_size参数指定page的大小，但区的大小不会改变。 当启用了innodb_file_per_table参数后创建的表大小默认是96KB，而不是立即是1MB，是由于每个段开始先使用32个页大小的fragment page(碎片页)来存放数据，对于一些小表可节省磁盘空间。
4.3 Page (页)
每个page默认大小为16K， InnoDB 1.2.x版本增加参数innodb_page_size参数指定page的大小，设置完成后表中所有page大小都固定，除非重新dump再imports数据，否则不能再修改page大小。page类型有：
(1) B-tree node - 数据页
(2) undo log page
(3) system page
(4) transaction system page
(5) insert buffer bitmap
(6) insert buffer free list
(7) uncompressed BLOB page
(8) compressed BLOB page