2022-04-22 一些R命令

1.BiocManager升级自己

BiocManager::install(version = "3.11")

2.升级R包

update.packages("S4vectors")

update.packages() #更新已经安装的包

3.参看软件版本

packageVersion("S4vectors")

4.利用Y叔的rvcheck查看包版本，升级R包

install.packages("rvcheck")

library(rvcheck)

check_r()

check_bioc('ggtree')

check_cran('emojifont')

check_github("GuangchuangYu/clusterProfiler")

update_all()  #更新所有的CRAN、Bioconductor、Github R包

参考：https://www.jianshu.com/p/ef919437835e

老来多健忘，唯不忘相思。。。。

R-安装、卸载、查看及卸除加载包

1. 安装包#

install.packages("BiocInstaller")

2. 卸载已安装包#

remove.packages("BiocInstaller")

3. 查看已加载包#

(.packages())

4. 卸除已加载包#

detach("package:BiocInstaller")

5. 查看已安装的包#

installed.packages()

6. 查看某个安装包提供的函数#

help(package="BiocInstaller")

7. 查看某个函数属于哪个包#

help("biocLite")