本专栏收录于《华为OD机试(JAVA)真题(A卷+B卷)》。
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一个 DNA 序列由 A/C/G/T 四个字母的排列组合组成。 G 和 C 的比例(定义为 GC-Ratio )是序列中 G 和 C 两个字母的总的出现次数除以总的字母数目(也就是序列长度)。在基因工程中,这个比例非常重要。因为高的 GC-Ratio 可能是基因的起始点。
给定一个很长的 DNA 序列,以及限定的子串长度 N ,请帮助研究人员在给出的 DNA 序列中从左往右找出 GC-Ratio 最高且长度为 N 的第一个子串。
DNA序列为 ACGT 的子串有: ACG , CG , CGT 等等,但是没有 AGT , CT 等等。
数据范围:字符串长度满足 1≤n≤1000 ,输入的字符串只包含 A/C/G/T 字母。
输入一个string型基因序列,和int型子串的长度。
找出GC比例最高的子串,如果有多个则输出第一个的子串。
public static void main(String[] args) {
Scanner sc = new Scanner(System.in);
while (sc.hasNext()) {
// 基因序列
String str = sc.nextLine();
// 子串长度
int n = Integer.parseInt(sc.nextLine());
// 最高的GC比例
double len = 0.0;
// 对应的子串
String result = "";
for (int i = 0; i < str.length() - n + 1; i++) {
String temp = str.substring(i, i + n);
// 使用正则表达式将非 GC 字母替换为空字符串,得到仅包含 GC 字母的子串
String son = temp.replaceAll("[^CG]", "");
double cur = (double) son.length() / (double) n;
if (cur > len) {
len = cur;
result = temp;
}
}
System.out.println(result);
}
}
ACGT
2
CG
ACGT长度为2的子串有AC,CG,GT3个,其中AC和GT2个的GC-Ratio都为0.5,CG为1,故输出CG 。
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