陈宇乔
陈宇乔

GATK_Mutect关于样本名报错

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这里需要输入两个样本名字，其实这两个$T and $N 的名字是限定死的，不可以乱取

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例如这里虽然文件名使用了sample20170711-4_I6_S6_L007，但是其实实际上正确的$N 应该是sample20170711-4_I6_S6_L007_R1。否则会出现类似的报错

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A USER ERROR has occurred: Bad input: Sample sample20170711-4_I6_S6_L007 is not in BAM header: [Msample20190927-1-I44_L4_D95T59, sample20170711-4_I6_S6_L007_R1]

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这样才可以正常运行

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