R安装R包时源链接连接不上处理办法

在windows或linux系统中，初次安装R可能会出现安装R包时镜像源加载不出来或，选择的repos无法连接的情况，如下：

image.png

解决方法1：
进入到R的安装目录，编辑/etc/Rprofile.site，

image.png

添加 options(download.file.method="libcurl")，重新打开Rstudio即可

解决方法2：
在每次安装R包前，指定CARN源：

options(repos=structure(c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")))

指定国内bioconductor源：

options(BioC_mirror=“http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/”)
BiocManager::install('dada2')

通过Rprofile自定义函数：

source.bioconductor <- function(){

            source("http://bioconductor.org/biocLite.R")

            options(BioC_mirror="http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")

}

通过调用source.bioconductor()函数，改变源并安装包。