GWAS--软件EMMAX和GEMMA

EMMAX

下载:http://csg.sph.umich.edu//kang/emmax/download/index.html
解压后即可直接用

前期需plink准备输入文件
运行命令:
emmax -v -d 10 -t [tped_prefix] -p [pheno_file] -k [kin_file] -o [out_prefix]


应用:样本间亲缘关系对结果的影响比较大的时候

GEMMA

下载:https://github.com/genetics-statistics/GEMMA


输出结果示例

测试

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