2270年，人类总人口数突破1000亿。科技空前发达，人类进入了第四纪元，史称——赛格纪元。人类不断探索更深层次的技术，挖掘自然与科技的平衡点。万物互联，智能AI，甚至于智能“生命”都被创造出来。在此基础上，各国首脑联合，打造了第二世界——一个脱离了宇宙法则的世界，一个完全由量子与数码混合的世界。人们可通过数码化进入第二世界，而本体不受影响。这一发明被人类称为“赛博格”。史称“赛博盛世”。然而，有光明的地方，也总会滋生黑暗。因为第二世界的数码性与法律的缺失，这里也是罪犯的天堂。—引
阿宇是第三纪元与第四纪元交替时出生的亿万万人中的一个。他们是上天赋予的幸运儿，没有经历第三纪元的苦痛，迎来了新时代的曙光。人们都说，他们是最有潜力的一代，无论是过去、现在亦或是未来。但阿宇只是个普通人，即使父母对他寄予厚望，他也从不理会，但也不去反驳。他认为人们把他们这一代人都吹上了天，可他们没有什么建树。普通人还是普通人，这一点他改变不了，也不想去改变。这样挺好的，阿宇总是这样说。当然，身在科技极其发达的“赛博盛世”，阿宇却有着别人向往的天赋--智能亲和。他天生就与智能机械有着感应，这使得他在智能领域方面有着常人无法匹敌的成就。但很可惜，阿宇只是个普通人。所以他选择了一个特殊的职业，一个亦正亦邪的黑客。
阿宇从不在乎别人对于他这个人的看法，他只在乎智能世界里她的成果。即使在赛博格的榜单上他以“羽”的名义霸占着第一的宝座，他仍然不关注新闻，不关注国家，不关注社会，包括不关注他自己。在他看来，网络是他的一切。其他的人，不值一提。只是，这一切的平静，都被即将而来的大暴乱打破。
大暴乱来的突然，没有征兆，也没有预警。或许有吧，但不知被什么力量阻挡了。导致暴乱来临之际，人们正幸福的或在家中吃着团圆饭，或是在火车站拥抱自己的爱人，又或是在街上漫无目的的走着。当然这都是在第二世界中的事。第一世界只有一个钢铁堡垒，这几乎覆盖了整个地球，甚至绵延到宇宙之中。在堡垒里，是数以亿万计的冷冻仓，或者说“棺材”。这是人们保持长生的原因，肉身不腐，只有意识的一小部分进入第二世界。这既保证了人们享受到了无尽生命的欲望，也让人们有了安身之所。这解决了几乎所有世界难题。唯独一个问题没有被解决，甚至没有被考虑。
公平。你出生在什么家庭，就决定你在第二世界中的地位。这几乎是终身性的。少数人能挣脱枷锁，但之后也加入了他们所讨厌的人的组织，变成了自己当初所厌恶声讨的人。这个问题在设计者眼里没有考虑。也有可能考虑了，但他刻意忽略了这个问题，美其名曰这是在促进发展、创造人才。同时也举出了很多例子来证明他的观点。最后，全票通过。当然，这也只是一种假设，毕竟谁也不能想到那么全面，也可能会是他疏忽了呢？
疏忽？或许吧，但是代价也随之而来。在底层的人民中爆发出了无声的轰鸣，就像大泽乡起义那样轰轰烈烈，各界各领域都爆发出了不同的声音。有悦耳的，也有刺耳的，总之很是混杂。数码化带来的好处和弊端都在这次大暴乱中涌现了出来。底层的人们不甘老天的不公，把愤怒强加在有钱人家的人身上。毕竟投个好胎是老天做决定。但他们不这样想，他们认为是有钱人抢占了他们的位置，享受了他们的待遇。他们是善良的，有钱人是邪恶的。那生活在金字塔最顶端的人怎么想呢？好吧，他们根本不关心这些他们眼中的蝼蚁的作为。小打小闹，不足为提。反正有明面上还在金字塔身上攀爬的人去对付。那么在塔身上的人们怎么想呢？他们惧怕底层人们积聚起来的力量，怕把他们从塔身上拽下去。于是，他们开始疯狂的对付底层的人们。无关是谁，活在底层就是你的不对。这是他们对手下说的最后一句话。在这一刻，矛盾爆发了出来，一直以来尖锐的阶级问题在第二世界中开始碰撞。有关的人、无关的人、底层的人、塔身的人、活着的人、死去的人，都被卷入这场大风暴。当上层的人开始意识到这次的风暴波及极广时，已经来不及，甚至于，他们也或多或少的被波及到了。有的人全身而退，避免影响自己；有的人打算趁机捞一笔，却无人在意那些卷入暴乱的人的安危。
第二世界的秩序坍塌了。但或许本就没有秩序。在暴乱达到最高潮的时候，这个原本统一的，被誉为第二世界的“赛博盛世”破灭了。社会动荡，烧杀抢掠，无恶不作，草菅人命这些人们认为本不会再出现在第四纪元的词汇逐渐浮现在人们眼前。只因一个或许是疏忽的问题，至高无上的神--秩序，变成了虚无。
再说回阿宇。他本就是个普通人，没有显赫的家世，也没有大笔的金钱。理应是这场暴乱中最大的受害者。却因为他对于智能的敏感，逃过一劫。他入侵了中央的银行，盗取了大笔的资金，在最短的时间内将自己包装成了一个成功人士。盘查没有追查到他身上。谁能想到一个穿着一身名牌，谈吐得体，用着最先进的智能光脑，名下拥有骇人的财产，还对各种高科技都了如指掌的人是个黑客兼江湖大盗呢？
阿宇在暴乱最疯狂的时候活了下来，身体没有遭到摧残。但他的精神受到了极大的创伤。他亲眼目睹了一个底层的人突然暴起，把另一个富家子弟顶在墙上暴打的场面。一把利刃刺透了富家子弟的腹部，鲜血和内脏被利刃连带着抽拉出来。底层的人大声叫喊着：“你们终会得到惩罚！你们罪有应得！”旁边的小孩对于无动于衷。不知从何时开始，这些本还没有对生命有何感想的时候，就已经习惯了死亡。这也如同一把尖刀刺进了阿宇的胸膛。地上到处都是残肢断臂，哭喊声、辱骂声不绝于耳。那犹如活地狱的场景狠狠震慑了阿宇的心灵。至于那些在背后操作的人，有的只是冷冷一笑，转身离去。
鲜血刺激着阿宇的神经，让他感到麻痹痛苦。第一次，他感受到了别人对他的影响。背负在身上的身份告诉他，那个底层人做的没有错，那个富家子弟该杀。可仅存的一点善念却在警醒着他，那是生命。他需要为此做点什么。阿宇思来想去，自己在第二世界最大的也是唯一的优势就是自己的黑客技术。他只能依靠自己的手和大脑。从小养成的懦弱的习惯在第一时间跳了出来，引诱着他，这不是你的事情，你都安全了啊，何必去趟这浑水？无边的深渊使得阿宇越陷越深，阿宇拼命寻找那一丝光亮，却只有无边的黑暗笼罩着他。迷茫，无措，胆怯，一系类负面的情绪从他的心里滋生出来。或许当世界都恐慌的时候，总有英雄出来拯救世界。阿宇不想当英雄，他也没法当英雄，他无法对抗那些强大的势力。他只能尽己所能在大暴乱的风暴中保全自我。他知道，一旦他露头出去帮助任何一方，他都不会再有立足之地。
但阿宇又是一个特殊的存在，他是唯一一个在两个层次又都有容身之处的人。阿宇决定隐藏在黑暗之中。他化名为“禹”，决心在大暴乱的背后推波助澜，解决两个层次的矛盾。但是，上千年之久的阶级问题，又岂能是仅凭一己之力就解决的呢？阿宇创造了一个智能AI生命来帮助自己，他给这个AI生命取名为“零”。同时，他有一个大胆的想法。
阿宇在接下来的几十天里，不断地计算推演，尝试完善他的计划的每一个细节。却在最后一步也是最关键的一步那里停下了。他算不出来结果会是如何，他只知道是无限的绝望，只有一个数字是最后的关键。阿宇这样想，两个层次的矛盾积怨已久，想要逆转或是调节以他的能力根本不可能，世界上的任何一个人都不可能。那他只有一个办法从根源出发。科技大爆炸引发的科技的鼎盛，从而使得第二世界的产生。在第二世界里的人们无需顾及什么，完全是安心意来。这使得人们的欲望开始膨胀式的增长，这才引发了大暴乱。究其原因是第二世界的产生还是本来人们心里的仇恨，阿宇不得而知。但是他也只能从第二世界入手。数据化产生的第二世界中的一切万物，都依靠着互联网连接在一起。阿宇可以尝试毁灭第二世界，或者说破坏第二世界的根本代码抹除一切数据。当然，得先把人们都从第一世界中唤醒。不过这很容易，加设进入第二世界的权限就可以。这自然是最直接的方式。可代价太大，况且人们在第一世界就不会再度引发大暴乱么？阿宇不得而知。所以这个方法被他列为最后的手段。阿宇还想到另外一种方式，让他的智能AI生命“零”链接上第二世界的代码，变成第二世界真正的“零”（最初的源代码就是零，数码的叠加开启如壹贰叁的排列模式进而形成数码化的万物）或者说是真正的“灵”。这样，它便能轻微地操控第二世界，改变时间的走向，解决他想解决的问题。
阿宇是这么想的，也是这么做的。他将第二世界的源代码输入到“零”中，让它成为承载第二世界的载体。阿宇将“零”输出为一个光脑，戴在身上，决定出去透透气，几十天的工作让他疲惫不已。但他却没有发现光脑闪烁的亮光在暗示着什么······
当阿宇走上街道时，还是一如既往的混乱，但却没有顶峰时的杂乱。大暴乱带来的影响太深刻了，以至于人们暂时还无法走出这种局面。不仅仅是阿宇，人们都已经习惯了这一切，见怪不怪，甚至于有些麻木。可“零”不同，它只是一个“刚出生”的AI生命，阿宇把他最后的善念和希望都寄托在了它身上。这股善念让这个小小的AI生命有了真正生命的迹象。它也目睹了惨状，也懂得了阿宇的心情。渐渐零的心态有了变化，它不再是它，而是一个新的生命。她结合了第二世界也融入了第二世界。这才是真正的灵，一个真正的她。
阿宇很惊讶，同时又有些喜悦。这使得他的计划有更大的几率成功。虽然这个几率可能微乎其微，但阿宇还是想试一试。他告诉了零自己的计划，并决定让零最后也能离开这个第二世界。零笑了笑，虽然她知道这不可能，但她不愿意消磨面前这个人的斗志，也有可能是给自己一个安慰吧。
在零的帮助下，阿宇耐心的蛰伏着。静静地等待着时机，也准备着时机。他们踏遍了第二世界的每一个地方，找到了许多和他们一样潜藏在暗处的人们，一切迎接胜利的到来。当然，阿宇没有提，零作为第二世界的“灵”，怎么会不知道呢。毁灭第二世界才是真正的选择。所以她在路程中也找到了第二世界最薄弱的地方。那里与第一世界最相近。
来了，最后的终结。阿宇他们失败了，棋差一招，终究是不敌暴乱中愤怒的人们。阿宇借用零推演的结果，提前准备了方案，虽然多少有些影响，却也没有达到左右暴乱的地步。阿宇只能不断地宣传这样的后果，以及人们未来的安危。即使他说的有理，是真实的，又有谁会相信呢？愤怒的人们中又有谁在意这个呢？无非是只顾及眼前的利益罢了。
还是到了最后一步，阿宇望向零，零还是对他笑了笑。阿宇觉得是那么的凄美，同时也是那么的迷人。零带着阿宇来到了第二世界最薄弱的地方，指了指脚下的土地，又指了指自己，一切不言而喻。阿宇明白，但他不能也不想这么做。零拉着他的手，摇了摇头，举起阿宇的头，将自己的额头贴在阿宇的手心上。阿宇感受到了清晰的触觉，那是真实的血肉的触觉。阿宇也知道，零如是想毁灭，自毁便是，何必与他浪费时间。但零想让他记住自己，也不要有心里的烦忧与自责。阿宇看着眼前的佳人，终于明白第二世界埋藏在深处的真谛。他对她说：“我，要带你出去。”
当阿宇痛哭着删除在零脑海里的代码时，人们看到了世界末日的景象。山川崩塌，山河破碎，天空浮现出黑漆的洞，一切都是崩坏的景象。暴乱中的人们开始意识到末日的降临。却无人在意这第二世界和第二世界中万物的生死。人们悔悟了暴乱的错误和引发的痛苦，握手言和，在世界末日的面前，人们终于统一了意见，和平才是“真谛”。
界限，破碎了。第一世界与第二世界的界限被打破了。无数的人们回到了那座巨大的钢铁堡垒中，第二世界的大地开始了格式化。天空、大海、植物、动物，无一幸免。在第一世界与第二世界的交界处，阿宇静静地伫立在那里。蓦地，阿宇脑海中闪过一丝明悟，他纵身一跃，跳进了无尽的深渊中，手里还攥着一个闪着光亮的光脑······
醒来，是刺眼的光明。阿宇缓缓起身，环顾四周，确认了这里是第一世界。看着人们和平相处，社会恢复安定。阿宇长舒了一口气。突然，他像是想起来什么似的，慢慢捧起自己的手心。一个散发着柔和光芒的小人静静地坐在那儿。她抱着膝盖，对着阿宇甜甜一笑，倾国倾城。她说到，“谢谢你。”