背景:
项目需要对数仓千万级数据进行分析、算法建模。因数据安全,数据无法大批量导出,需在集群内进行分析建模,但CDH集群未安装python3 环境,需在无网情况下离线配置python3环境及一系列第三方库。
采取策略,使用外部联网linux环境创建python3虚拟环境,然后整体迁移集群环境。
>> sh Anaconda3-2023.03-1-Linux-x86_64.sh
>> conda create -n python3.7 python=3.7 # 创建py3.7虚拟环境,CDH集群spark2.4.0最高支持python3.7
>> conda activate python3.7 # 激活虚拟环境
>> pip install pyhive,impyla,pyspark # pip会自动安装thrif等依赖包,若报gcc等系统问题,具体问题百度分析
>> pip install ipykernel # 创建jupyter内核使用,使用jupyterlab远程进行数据分析
>> pip install scikit-learn、lightgbm # 安装其他需要第三方库
外部机器/anaconda3/envs>> zip -r python3.7.zip ./python3.7 # 压缩整个虚拟环境
集群/anaconda3/envs>> unzip python3.7.zip # 大功告成
迁移后 >> ./pip 提示 找不到python解释器
迁移后 ipykernel 提示找不到python解释器
解决:
进入envs/python3.7/bin 下,修改pip、pip3、ipykernel等命令内容,将第一行改为集群python对应路径。
#1 激活、退出虚拟环境
>> conda activate python3.7 [conda deactivate]
#2. 虚拟环境下
>> ipython kernel install --user --name=python3.7
#3. 重启jupyter-lab 查看即可
>> nohup ./jupyter-lab --allow-root > /data/xx/anaconda3/log.out &
# 备注:jupyterlab 服务由anaconda3主环境base创建
>> jupyter-lab --generate-config (配置远程访问)
>> vim jupyter_lab_config.py
'''
c.ServerApp.ip = '0.0.0.0'
c.ServerApp.port = 8888
c.ServerApp.passwd = 8888
c.ServerApp.notebook_dir = '/data/xx/anaconda3/data'
c.ServerApp.open_browser = False
c.NotebookApp.passwords = {
'user1': 'sha1:user1_password_hash', # >> python -c "from notebook.auth import passwd; print(passwd())" 生成用户密码
'user2': 'sha1:user2_password_hash',
'user3': 'sha1:user3_password_hash'
}
'''
from pyhive import hive
from impala.dbapi import connect
from impala.util import as_pandas
## python 读取数仓第一种方式 hive:jbdc
# pyhive 连接
conn = hive.Connection(host='namenode',port=10000,database='库名')
cursor = conn.cursor()
# 执行查询
cursor.execute('desc user_info')
col_name = [i[0] for i in cursor.fetchall()]
cursor.execute('select * from user_info limit 2')
data = cursor.fetchall()
print(pd.DataFrame(data=data,columns=col_name))
# 关闭hive连接
cursor.close()
conn.close()
## python 读取数仓第二种方式 impala:jbdc
# 连接impala
conn = connect(host='namenode',port=21050,database='库名')
cursor = conn.cursor()
# 执行查询
cursor.execute('select * from user_info where name is not null')
data = as_pandas(cursor)
备注:使用pyhive和impyla 读取数据,还是读取到一台集群节点内存上,速度慢,占内存,且分析比较困难,适合小批量处理。如处理千万级数据,还是使用pyspark进行并行分析。
## python 分析大量数据 pyspark
import os
from pyspark import SparkContext,SparkConf
from pyspark.sql import SparkSession
import warnings
warnings.filterwarnings(action='ignore')
# 制定集群spark、hadoop家目录
os.environ['SPARK_HOME'] = '/opt/cloudera/parcels/CDH-6.3.4-1.cdh6.3.4.p0.6751098/lib/spark'
os.environ['HADOOP_CONF_DIR'] = '/opt/cloudera/parcels/CDH-6.3.4-1.cdh6.3.4.p0.6751098/lib/hadoop'
os.environ['PYSPARK_PYTHON'] = './py3/bin/python'
parameters = [('spark.app.name','sklearn'),
('spark.yarn.dist.files','hdfs://namenode:8020/python3/python3.7.zip#py3')
('spark.master','yarn'),
('spark.submit.deploymode','client'),
]
conf = SparkConf().setAll(parameters)
#sc = SparkContext.getOrCreate(conf=conf)
spark = SparkSession.builder.config(conf=conf).enableHiveSupport().getOrCreate()
spark
备注:一般会报
Permission denied: user=root, access=WRITE, inode=“/user/spark/applicationHistory”:spark:spark:drwxr-xr-x 权限错误,
这是因为写代码得用户时jupyter服务启动用户,而CDH 中hadoop、hive、spark 文件的用户分别为hdfs、hive、spark用户。