联合分析专题--动物篇（3）！--带你了解多组学联合分析在动物品种选育与生长发育方向的研究思路

多组学研究重要性

1.提供全面信息：多组学技术可同时测定基因、蛋白质及代谢物等不同层面之间的相关性，更好地解释生物系统的复杂性。

2.发现不同层面的生物标志物：通过全面分析，可以鉴定出不同状态下相关的生物标志物，为疾病诊断和治疗方法提供新途径。

3.构建调控通路：探究基因在不同状态下的表达情况及蛋白质对基因的调控作用，构建调控网络，有助于揭示动物在不同状态下的复杂性，更好地理解动物生长发育、适应环境及疾病发生的过程。

4.提高效率：一次试验可得到多组学的数据，减少了样本采集的时间和成本，提高了科研效率，节约了试验材料。

研究思路

研究方向

1.动物品种选育与生长发育

        通过对多组学数据的整合，绘制“基因-蛋白-代谢物-表型”的关系网络，从而筛选与性状相关的生物标志物，解析遗传和生长发育的相关机制，为新品种的选育、鉴定及生长发育提供参考。

2.食品品质与安全

3.动物生存环境毒理学研究

4.动物营养与健康

今天重点给大家分享多组学联合分析在动物品种选育与生长发育方向的研究思路！

案例分享

案例1

文章题目：梅花鹿生命早期发育背后的代谢变化

发表期刊：Microbiome

影响因子：16.837

测序方式：代谢组+转录组+微生物组

研究背景

反刍动物的胃肠道（GIT）微生物组及其代谢极大地影响宿主的新陈代谢和生长。然而，对跨宿主-微生物组轴发生的双向相互作用的完整理解仍然难以捉摸，特别是在生命早期的关键发育阶段。在这里，基于综合的多组学方法同时探究在梅花鹿三个关键的早期生命阶段来自五个GIT区域的微生物群的分类和功能属性，以及梅花鹿中肝脏、肌肉、尿液和血清的代谢特征。

研究思路

案例2

文章题目：鲤鱼肠道菌群与转录组水平的相互作用

发表期刊：Frontiers in microbiology

影响因子：6.064

测序方式：转录组＋16s微生物多样性

研究背景

近年来，肠道微生物对宿主生产性能的影响受到广泛关注。研究发现约10%的宿主转录组受微生物调节，主要包括免疫、细胞增殖和代谢功能相关基因。肠道微生物与宿主基因表达之间的相互作用机制会影响饮食行为、消化过程、免疫功能和其他生理现象。一天中微生物的活动会改变宿主的生物节律、表观遗传学和代谢产物。当微生物群落内稳态的节律被破坏时，宿主的正常染色质和基因表达水平将发生变化，肠-肝轴基因表达的新机制将被激活，这种相互作用主要通过脑和肝的远程控制模式实现。因此，作者运用转录组和微生物多样性联合分析来解析新黄河鲤品种的肠道微生物群通过调节肠道基因表达影响其生长性能的方式，以此为黄河鲤新品种的选育提供参考。

研究思路