容器资料: Docker和Singularity

容器资料

Docker和Singularity

Docker比较适合测试: 环境适配,每种环境对应一个容器。Docker需要host宿主机上运行Docker服务(root权限),隔离性很高，但会牺牲性能，对GPU环境支持不好(需要安装NVIDIAN公司的插件才能把GPU暴露给container)

Sigularity可认为专为HPC环境开发的容器工具,提供对MPICH和OpenMPI并行开发支持，提供对GPU支持，几乎无性能损失。一个打包的应用镜像，到处部署使用。

网络资料

• Running Intel® MPI Library in Containers
• PITT: Singularity Containers
• Singularity Doc 3.5
• Singularity: GPU Support (NVIDIA CUDA & AMD ROCm)
• Singularity: MPI支持
• Singularity-tutorial.github.io
• Introduction to containers and Singularity
• singularity和docker的安装使用
• singularity 安装与使用
• Singularity——生信流程搭建的新宠儿
• Github: Singularity/apptainer
• NASA: Singularity使用
• UL HPC Tutorial: HPC Containers with Singularity
• Singularity 容器使用介绍
• Building Singularity containers locally