根据SRA登录号从NCBI下载原始数据

1.介绍

介绍数据下载的方法有很多，相关介绍内容也很多。
1.NCBI的sratoolkit 工具集中的prefetch、fastq-dump和sam-dump
2.Aspera Connect软件
3.下载NCBI SRA数据的最佳方法
不同的方法或简单，或复杂不考虑，我最习惯的只是其中的一种wget方案，只需要提供SRA登录号，自动下载文件到当前文件夹。

2.以SRR10030315为例，具体操作如下：

sh sra.download.sh SRR10030315

sra.download.sh 脚本内容为：
wget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/${1:0:3}/${1:0:6}/${1}/${1}.sra

如果想实现多个SRA登录号下载，可将SRA存入文件name中，然后运行：

for n in `cat name` ; do sh sra.download.sh $n ; done

name文件内容为：
SRR10030315
SRR10030316
....