09Seaborn 数据可视化基础入门

Seaborn 介绍

Seaborn 基于 Matplotlib 核心库进行了更高阶的 API 封装,可以让你轻松地画出更漂亮的图形。Seaborn 的漂亮主要体现在配色更加舒服、以及图形元素的样式更加细腻,下面是 Seaborn 官方给出的参考图。


image.png

Seaborn 具有如下特点:
内置数个经过优化的样式效果。
增加调色板工具,可以很方便地为数据搭配颜色。
单变量和双变量分布绘图更为简单,可用于对数据子集相互比较。
对独立变量和相关变量进行回归拟合和可视化更加便捷。
对数据矩阵进行可视化,并使用聚类算法进行分析。
基于时间序列的绘制和统计功能,更加灵活的不确定度估计。
基于网格绘制出更加复杂的图像集合。
除此之外, Seaborn 对 Matplotlib 和 Pandas 的数据结构高度兼容。

快速优化图形

当我们使用 Matplotlib 绘图时,默认的图像样式算不上美观。此时,就可以使用 Seaborn 完成快速优化。

import matplotlib.pyplot as plt
%matplotlib inline

x = [1, 3, 5, 7, 9, 11, 13, 15, 17, 19]
y_bar = [3, 4, 6, 8, 9, 10, 9, 11, 7, 8]
y_line = [2, 3, 5, 7, 8, 9, 8, 10, 6, 7]

plt.bar(x, y_bar)
plt.plot(x, y_line, '-o', color='y')
import seaborn as sns

sns.set()  # 声明使用 Seaborn 样式

plt.bar(x, y_bar)
plt.plot(x, y_line, '-o', color='y')

相比于 Matplotlib 默认的纯白色背景,Seaborn 默认的浅灰色网格背景看起来的确要细腻舒适一些。而柱状图的色调、坐标轴的字体大小也都有一些变化。
sns.set() 的默认参数为:

sns.set(context='notebook', style='darkgrid', palette='deep', font='sans-serif', font_scale=1, color_codes=False, rc=None)

context='' 参数控制着默认的画幅大小,分别有 {paper, notebook, talk, poster} 四个值。其中,poster > talk > notebook > paper。
style='' 参数控制默认样式,分别有 {darkgrid, whitegrid, dark, white, ticks},你可以自行更改查看它们之间的不同。
palette='' 参数为预设的调色板。分别有 {deep, muted, bright, pastel, dark, colorblind} 等,你可以自行更改查看它们之间的不同。
剩下的 font='' 用于设置字体,font_scale= 设置字体大小,color_codes= 不使用调色板而采用先前的 'r' 等色彩缩写。

Seaborn 绘图 API

根据图形的适应场景,Seaborn 的绘图方法大致分类 6 类,分别是:关联图、类别图、分布图、回归图、矩阵图和组合图。而这 6 大类下面又包含不同数量的绘图函数。
关联图

image.png

relplot 是 relational plots 的缩写,其可以用于呈现数据之后的关系,主要有散点图和条形图 2 种样式。本次实验,我们使用鸢尾花数据集进行绘图探索。
在绘图之前,先熟悉一下 iris 鸢尾花数据集。数据集总共 150 行,由 5 列组成。分别代表:萼片长度、萼片宽度、花瓣长度、花瓣宽度、花的类别。其中,前四列均为数值型数据,最后一列花的分类为三种,分别是:Iris Setosa、Iris Versicolour、Iris Virginica。

# 从国内镜像下载 seaborn 数据集避免下一步加载数据集失败
!wget -nc "https://labfile.oss.aliyuncs.com/courses/2616/seaborn-data.zip"
!unzip seaborn-data.zip -d ~/
iris = sns.load_dataset("iris")
iris.head()

我们指定 x和 y的特征,默认可以绘制出散点图

sns.relplot(x="sepal_length", y="sepal_width", data=iris)

加入类别特征对数据进行着色,就更好一些了

sns.relplot(x="sepal_length", y="sepal_width", hue="species", data=iris)

Seaborn 的函数都有大量实用的参数,例如我们指定 style 参数可以赋予不同类别的散点不同的形状。

sns.relplot(x="sepal_length", y="sepal_width",
            hue="species", style="species", data=iris)

不只是散点图,该方法还支持线形图,只需要指定 kind="line" 参数即可。线形图和散点图适用于不同类型的数据。线形态绘制时还会自动给出 95% 的置信区间。

sns.relplot(x="sepal_length", y="petal_length",
            hue="species", style="species", kind="line", data=iris)

relplot 看作是 scatterplot 和 lineplot 的结合版本。
Seaborn 中的 API 分为 Figure-level 和 Axes-level 两种。relplot 就是一个 Figure-level 接口,而 scatterplot 和 lineplot 则是 Axes-level 接口。
Figure-level 和 Axes-level API 的区别在于,Axes-level 的函数可以实现与 Matplotlib 更灵活和紧密的结合,而 Figure-level 则更像是「懒人函数」,适合于快速应用。
例如上方的图,我们也可以使用 lineplot 函数绘制

sns.lineplot(x="sepal_length", y="petal_length",
             hue="species", style="species", data=iris)

类别图
类别图的 Figure-level 接口是 catplot,其为 categorical plots 的缩写。而 catplot 实际上是如下 Axes-level 绘图 API 的集合:

分类散点图:
stripplot() (kind="strip")
swarmplot() (kind="swarm")

分类分布图:
boxplot() (kind="box")
violinplot() (kind="violin")
boxenplot() (kind="boxen")

分类估计图:
pointplot() (kind="point")
barplot() (kind="bar")
countplot() (kind="count")

catplot 绘图效果,该方法默认是绘制 kind="strip" 散点图。

sns.catplot(x="sepal_length", y="species", data=iris)

kind="swarm" 可以让散点按照 beeswarm 的方式防止重叠,可以更好地观测数据分布。

sns.catplot(x="sepal_length", y="species", kind="swarm", data=iris)

hue= 参数可以给图像引入另一个维度,如果一个数据集有多个类别,hue= 参数就可以让数据点有更好的区分。
绘制箱线图:

sns.catplot(x="sepal_length", y="species", kind="box", data=iris)

绘制小提琴图:

sns.catplot(x="sepal_length", y="species", kind="violin", data=iris)

绘制增强箱线图:

sns.catplot(x="species", y="sepal_length", kind="boxen", data=iris)

绘制点线图:

sns.catplot(x="sepal_length", y="species", kind="point", data=iris)

绘制条形图:

sns.catplot(x="sepal_length", y="species", kind="bar", data=iris)

绘制计数条形图:

sns.catplot(x="species", kind="count", data=iris)

分布图
分布图主要是用于可视化变量的分布情况,一般分为单变量分布和多变量分布。当然这里的多变量多指二元变量,更多的变量无法绘制出直观的可视化图形。
Seaborn 提供的分布图绘制方法一般有这几个: jointplotpairplotdistplotkdeplot
Seaborn 快速查看单变量分布的方法是 distplot。默认情况下,该方法将会绘制直方图并拟合核密度估计图。

sns.distplot(iris["sepal_length"])

distplot 提供了参数来调整直方图和核密度估计图,例如设置 kde=False 则可以只绘制直方图,或者 hist=False 只绘制核密度估计图。当然,kdeplot 可以专门用于绘制核密度估计图,其效果和 distplot(hist=False) 一致,但 kdeplot 拥有更多的自定义设置。

sns.kdeplot(iris["sepal_length"])

jointplot 主要是用于绘制二元变量分布图。例如,我们探寻 sepal_length 和 sepal_width 二元特征变量之间的关系。

sns.jointplot(x="sepal_length", y="sepal_width", data=iris)

jointplot 并不是一个 Figure-level 接口,但其支持 kind= 参数指定绘制出不同样式的分布图。例如,绘制出核密度估计对比图。

sns.jointplot(x="sepal_length", y="sepal_width", data=iris, kind="kde")

六边形计数图:

sns.jointplot(x="sepal_length", y="sepal_width", data=iris, kind="hex")

回归拟合图:

sns.jointplot(x="sepal_length", y="sepal_width", data=iris, kind="reg")

pairplot 其支持一次性将数据集中的特征变量两两对比绘图。默认情况下,对角线上是单变量分布图,而其他则是二元变量分布图。

sns.pairplot(iris)

引入第三维度 hue="species" 会更加直观。

sns.pairplot(iris, hue="species")

回归图
回归图的绘制函数主要有:lmplotregplot
regplot 绘制回归图时,只需要指定自变量和因变量即可,regplot 会自动完成线性回归拟合。

sns.regplot(x="sepal_length", y="sepal_width", data=iris)

lmplot 同样是用于绘制回归图,但 lmplot 支持引入第三维度进行对比,例如我们设置 hue="species"。

sns.lmplot(x="sepal_length", y="sepal_width", hue="species", data=iris)

矩阵图
矩阵图中最常用的就只有 2 个,分别是:heatmapclustermap
heatmap 主要用于绘制热力图。

import numpy as np

sns.heatmap(np.random.rand(10, 10))

热力图在某些场景下非常实用,例如绘制出变量相关性系数热力图。
clustermap 支持绘制 层次聚类 结构图。如下所示,我们先去掉原数据集中最后一个目标列,传入特征数据即可。

iris.pop("species")
sns.clustermap(iris)

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