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#生物信息生物学生物信息学
胚系突变(GermlineMutation)和体细胞突变(SomaticMutation)在WES、WGS、GenePanel检测时常常遇到,二者最大的区别是胚系突变可以遗传给后代,而体细胞突变不能够遗传给后代。本文将从形成原因、遗传性、功能、发生时期、变异检测几个方面介绍二者的区别。上图,直观理解二者区别形成原因Germlinemutations主要是由于生殖细胞(germcells)突变导致,
- Sigma-Aldrich细胞培养实验方案:恰当的无菌技术和细胞无菌处理
橘子洲头
其他
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- matlab画信号图方法,献给初学者:手把手教你绘制信号通路图
信号通路是指能将细胞外的分子信号经细胞膜传入细胞内发挥效应的一系列酶促反应通路。细胞信号通路图是科研研究过程中最常见也是最常用到的,如何绘制适合我们自己科研课题的信号通路图呢?可以试试pathwaybuildertool软件。这款软件简单易学,即便是零基础的同学,也可以做出漂亮的信号通路。1.首先,打开PathwayBuilderTool2.0软件,软件自带分子生物学会用到的基本元素,如不同的细胞
- 深度学习 最简单的神经网络 线性回归网络
用最简单的线性模型讲清神经网络训练全流程,让你5分钟看懂AI是怎么学会预测的1真实神经元结构真实神经元包括:树突接收其他神经元传来的电信号(输入)。细胞核负责整合输入信号并产生动作电位。轴突传导动作电位到下一个神经元。突触释放神经递质,将信号传递给下一个神经元的树突。2线性回归神经网络原理(与神经元对比)假设输入是x_1,x_2,x_3x\_1,x\_2,x\_3x_1,x_2,x_3,权重是w_
- scanpy保存图片的常用方法汇总
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在使用Scanpy(一个用于单细胞RNA测序数据分析的Python库)时,保存图片(如可视化结果)是常见的操作。Scanpy的绘图功能主要基于Matplotlib和Seaborn,保存图片的方法也与这些库的保存机制一致。以下是Scanpy保存图片的详细方法及注意事项:1.基本保存图片的方法Scanpy的绘图函数(如sc.pl.umap、sc.pl.tsne、sc.pl.pca等)通常会返回Matp
- 量子传感探针:金刚石NV色心实现细胞级磁弹性成像(分辨率10nm)技术解析
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一、技术原理与核心突破金刚石氮-空位色心(NV色心)作为原子级量子传感器,其磁弹性成像能力源于电子自旋态与环境磁场的量子相干相互作用,结合纳米探针技术实现细胞级分辨率。核心技术原理包括:1.NV色心量子传感机制磁弹性耦合模型:NV色心的自旋哈密顿量可表示为:H=DSz2+γeB⋅S+λϵ⋅SH=DS_z^2+\gamma_e\mathbf{B}\cdot\mathbf{S}+\lambda\mat
- 支持向量机(SVM)在病理切片图像分类(癌细胞检测,Camelyon16/17、TCGA)中的应用与实现
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支持向量机(SVM)在病理切片图像分类(癌细胞检测,Camelyon16/17、TCGA)中的应用与实现病理切片图像分类是医学影像分析的重要领域,特别是在癌细胞检测中,SVM因其对高维数据和小样本场景的优异性能,成为一种经典且有效的分类方法。本文将深入探讨SVM在Camelyon16/17和TCGA数据集上的应用,全面覆盖概念与原理、应用场景、及挑战与应对策略,欢迎感兴趣的阅读。[文中示例代码仅供
- AI与脑科学:相互启发,探索智能的本质
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AI与脑科学:相互启发,探索智能的本质人类大脑的物理组件正被逐个映射为数字模型,而人工智能的“黑箱”中则自发涌现出类人的思维结构,两大前沿领域的碰撞正重塑我们对“智能”的理解。2025年初,东南大学黄广斌教授团队发表了一项开创性研究,提出通过“细胞级别的AI孪生方法”将人脑物理组件转换为数字模型,从理论上证明:不受限制的AI能以任意小误差逼近人脑功能,并在25年内超越人类智能。这项集结了哈佛医学院
- 表观遗传风暴:深圳AI-BioFab终极防御战全纪实
前言前些天发现了一个巨牛的人工智能免费学习网站,通俗易懂,风趣幽默,忍不住分享一下给大家。点击跳转到网站⚡《表观遗传风暴:深圳AI-BioFab终极防御战全纪实》副标题:抗癌疫苗灌装倒计时90秒惊现组蛋白叛乱,中国启动虫洞计算化解文明级生物危机2025年7月2日14:26光明科学城急电当第184支抗癌疫苗注入冷链罐的瞬间,B3层突爆刺眼蓝光!培养舱内数千细胞染色体疯狂解旋,量子钟在14:26:03
- 【领码思考】ESG画卷里的项目管理新篇:AI赋能下的绿色智造之路
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央国企理念篇AI应用人工智能ESG项目管理AI赋能绿色转型可持续发展
摘要ESG(环境、社会、治理)理念正悄然融入项目管理的每个细胞,成为驱动项目成功的新引擎。本文聚焦ESG如何与项目管理深度融合,立体呈现各阶段ESG应用场景,围绕AI与数字化工具的协同赋能,解析项目经理如何在绿色转型中实现角色跃迁。通过流程图与表格精炼框架,强化理论指导与实践操作,并结合当下热点新技术,旨在为项目团队和企业管理层提供清晰可落地的全周期ESG实施路径,开启项目管理可持续发展的智慧新纪
- 【杂谈】- AlphaGenome:解锁基因组奥秘的强大AI引擎
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AlphaGenome:解锁基因组奥秘的强大AI引擎文章目录AlphaGenome:解锁基因组奥秘的强大AI引擎1、解读遗传指令的挑战2、理解AlphaGenome3、突破背后的科学4、性能基准5、实际应用和研究影响6、当前的局限性和未来方向7、普及基因组AI8、展望未来9、总结人类DNA中蕴含着约30亿个遗传密码,构成了生命的神秘蓝图。然而,我们对于这本庞大“指令手册”中细胞运作方式的认知,却仅
- A systems-biology model of the tumor necrosis factor (TNF) interactions with TNF receptor 1 and 2
但她还是走了
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Asystems-biologymodelofthetumornecrosisfactor(TNF)interactionswithTNFreceptor1and2摘要注意:聚集使肿瘤坏死因子受体能够刺激细胞内信号传导。模拟了可溶性配体诱导的肿瘤坏死因子受体1和肿瘤坏死因子受体2的聚集行为。方法:一个结构化的、基于规则的模型实现了配体无关的配体前结合装配域(PLAD)介导的未连接和连接的肿瘤坏死因
- 长短期记忆(LSTM)网络模型
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一、概述 长短期记忆(LongShort-TermMemory,LSTM)网络是一种特殊的循环神经网络(RNN),专门设计用于解决传统RNN在处理长序列数据时面临的梯度消失/爆炸问题,能够有效捕捉长距离依赖关系。其核心在于引入记忆细胞(CellState)和门控机制(GateMechanism),通过控制信息的流动来实现对长期信息的存储与遗忘。二、模型原理 LSTM由记忆细胞和三个门控单元(遗
- LSTM(Long Short-Term Memory)模型的深度解析
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在6.28号我发了一个博客《RNN(循环神经网络)与LSTM(长短期记忆网络)输出的详细对比分析》,但是我并未详细讲解LSTM,LSTM是循环神经网络中的一个模型,然而通过这篇博客给大家深度解析一下LSTM,重点关注其内部结构和参数。LSTM是为了解决标准RNN在处理长序列时出现的梯度消失/爆炸问题而设计的一种特殊循环神经网络结构。它的核心在于引入了门控机制和细胞状态,使得网络能够有选择地记住或忘
- DeepMind 发布 AlphaGenome,1 秒内完成所有模态和细胞类型的变异效应预测
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谷歌DeepMind的Alpha系列再添新成员——AlphaGenome,其能够更全面、准确地预测人类DNA序列中单个变异或突变,如何影响一系列调控基因的生物过程。AlphaGenome模型以长达100万个碱基对的DNA序列为输入,预测数千种与其调控活性相关的分子属性,同时还可以通过比较变异与未变异序列的预测结果,评估基因变异或突变的影响。该模型建立在DeepMind此前的基因组模型Enforme
- 稳转细胞株构建全攻略:从理论到实践的生物制药核心技术解析
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为何稳转细胞株成为生物制药领域的“兵家必争之地”?稳转细胞株被称为“药物研发的基石”,是单克隆抗体、双抗、疫苗、ADC等生物制品规模化生产的核心环节,还是药物生产成本、效率和质量的关键决定因素。一株高产稳定的细胞株有可能直接缩短药物上市周期3-5年。稳定细胞株因其稳定性高,适用于各种研究应用,包括重组蛋白、抗体生产、结构生物学和功能性研究等。那么,如何打造一株理想的稳转细胞株呢?义翘神州在重组表达
- 继 Evo 2 之后,Arc Institute 发布首个虚拟细胞模型 STATE,训练数据涉及 70 种不同细胞系
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众所周知,人体由不同类型的细胞组成——免疫细胞在感染发生时可引发炎症反应以抵御病原体;干细胞具有分化潜能,可生成多种组织类型;而癌细胞则通过逃避生长调控信号,实现异常增殖。尽管这些细胞在功能和形态上差异巨大,但它们几乎都拥有相同的基因组。细胞的独特性并非来自DNA序列本身的差异,而是源于它们如何调控和使用相同的基因信息。换言之,细胞的特性源于基因表达的差异,而一个细胞的基因表达模式不仅决定了它属于
- 【细胞自噬】上班减脂最佳方案分析
文章目录总结一、空腹时长与饥饿感曲线**对照表****关键说明**二、**长时间空腹(24-100小时)饥饿感与代谢曲线细化表****关键生理机制与注意事项****应用建议**三、少量进食会中断细胞自噬吗**1.细胞自噬的核心触发条件****2.少量进食对自噬的影响****3.关键时间阈值****4.实践建议(平衡自噬与健康)****5.研究支持****总结**四、西洋参与细胞自噬**1.西洋参的
- AI助力基因数据分析:用Python玩转生命密码的秘密
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AI助力基因数据分析:用Python玩转生命密码的秘密说到基因数据,听起来是不是感觉有点高大上?其实,基因数据分析正变得越来越“接地气”,而AI正是这条路上的神奇钥匙。今天,咱们就用Python聊聊如何利用AI技术做基因数据分析与建模,帮你破解生命的密码,找到疾病预测、个性化医疗的新路子。一、基因数据为何如此特别?基因组测序技术让我们能够获取人体细胞内数以百万计的DNA序列变异信息。但数据量巨大、
- 肿瘤靶向治疗中NCCN指南与临床试验入组标准的自动匹配系统(匹配精度98.7%)
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一、核心概念解析NCCN指南的权威性与结构定位:NCCN指南是全球肿瘤诊疗的“金标准”,覆盖97%的美国癌症患者管理决策,基于证据等级(1/2A/2B/3类)和专家共识制定,每年至少更新一次。核心内容:按癌种分类(如非小细胞肺癌、乳腺癌)的靶向治疗路径,明确生物标志物检测要求(如EGFR、ALK突变)。治疗推荐分级:Category1(高级别证据)和2A(专家共识)推荐纳入NCCN纲要,直接影响医
- 致癌分子的失控狂飙:EGFR 信号通路如何驱动肿瘤生长,又如何成为精准治疗靶标?
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在细胞构成的精密王国里,每个分子都遵循着既定的规则运行。然而,当表皮生长因子受体(EGFR)这一关键分子因某种原因失控,过量表达并持续激活时,一场导致细胞疯狂增殖的“叛乱”便悄然启动。作为肿瘤发生发展的核心驱动者,EGFR通路的异常激活不仅揭开了癌细胞恶性转化的序幕,更成为现代肿瘤精准治疗的重要突破口。一、肿瘤基因的双重面孔:原癌基因如何沦为“叛变者”肿瘤的发生源于基因世界的失衡,其中原癌基因与抑
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1.组学数据:生命系统的分子层面快照定义:组学数据是指利用高通量实验技术,对生物样本(细胞、组织、个体等)在特定状态下,某一类生物分子全集进行系统性、大规模定量测量所产生的数据集。核心特征:全局性(Global):目标是对该分子层面尽可能完整的覆盖(如全基因组、全转录组、全蛋白质组),而非单个分子。高通量(High-throughput):依赖先进平台(如二代/三代测序、高分辨率质谱、芯片技术),
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- 45-生命游戏
根据百度百科,生命游戏,简称为生命,是英国数学家约翰·何顿·康威在1970年发明的细胞自动机。给定一个包含m×n个格子的面板,每一个格子都可以看成是一个细胞。每个细胞都具有一个初始状态:1即为活细胞(live),或0即为死细胞(dead)。每个细胞与其八个相邻位置(水平,垂直,对角线)的细胞都遵循以下四条生存定律:如果活细胞周围八个位置的活细胞数少于两个,则该位置活细胞死亡;如果活细胞周围八个位置
- 半导体材料仿真:量子点材料仿真_(20).量子点材料在生物医学中的应用案例
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量子点材料在生物医学中的应用案例在上一节中,我们讨论了量子点材料的基本性质和合成方法。本节将重点介绍量子点材料在生物医学领域的应用案例,包括生物标记、成像、药物递送和光疗等方面。通过这些案例,我们将深入了解量子点材料在生物医学中的独特优势和潜在应用。1.量子点在生物标记中的应用1.1生物标记的基本原理生物标记是指使用特定的化学或物理方法对生物分子、细胞或组织进行标记,以便于观察和分析。量子点由于其
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CorticalLabsCL1生物计算机的技术参数与核心功能CorticalLabsCL1生物计算机的技术参数与核心功能如下:1.技术参数:核心组件:CL1将人类神经元与硅芯片相结合,形成一个动态、可持续且节能的计算系统。每个CL1单元配备30个片上脑机接口,整机功耗大约在850W至1000W之间。内部结构:CL1是一个大型箱子,内部包含维持人类脑细胞生存所需的系统,如电波过滤系统、媒体存储空间、
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braveCS
zookeeper
Required Software
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2)推荐使用ensemble的ZooKeeper(至少3台),并run on separate machines
3)在Yahoo!,zk配置在特定的RHEL boxes里,2个cpu,2G内存,80G硬盘
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1)数据目录里的文件是zk节点的持久化备份,包括快照和事务日
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项目中需要同时连接多个数据库的时候,如何才能在需要用到哪个数据库就连接哪个数据库呢?
Spring中有关于dataSource的配置:
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例如,你想myuser使用mypassword从任何主机连接到mysql服务器的话。
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如果你想允许用户myuser从ip为192.168.1.6的主机连接到mysql服务器,并使用mypassword作
- CommonDAO(公共/基础DAO)
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好久没有更新博客了,最近一段时间工作比较忙,所以请见谅,无论你是爱看呢还是爱看呢还是爱看呢,总之或许对你有些帮助。
DAO(Data Access Object)是一个数据访问(顾名思义就是与数据库打交道)接口,DAO一般在业
- 直言有讳
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1.转载地址:http://blog.csdn.net/jasonblog/article/details/10813313
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“直言有讳”是阿里巴巴提倡的一种观念,而我在此之前并没有很深刻的认识。为什么呢?就好比是读书时候做阅读理解,我喜欢我自己的解读,并不喜欢老师给的意思。在这里也是。我自己坚持的原则是互相尊重,我觉得阿里巴巴很多价值观其实是基本的做人
- 安装CentOS 7 和Win 7后,Win7 引导丢失
随便小屋
centos
一般安装双系统的顺序是先装Win7,然后在安装CentOS,这样CentOS可以引导WIN 7启动。但安装CentOS7后,却找不到Win7 的引导,稍微修改一点东西即可。
一、首先具有root 的权限。
即进入Terminal后输入命令su,然后输入密码即可
二、利用vim编辑器打开/boot/grub2/grub.cfg文件进行修改
v
- Oracle备份与恢复案例
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一. 理解什么是数据库恢复当我们使用一个数据库时,总希望数据库的内容是可靠的、正确的,但由于计算机系统的故障(硬件故障、软件故障、网络故障、进程故障和系统故障)影响数据库系统的操作,影响数据库中数据的正确性,甚至破坏数据库,使数据库中全部或部分数据丢失。因此当发生上述故障后,希望能重构这个完整的数据库,该处理称为数据库恢复。恢复过程大致可以分为复原(Restore)与
- JavaEE开源快速开发平台G4Studio v5.0发布
無為子
我非常高兴地宣布,今天我们最新的JavaEE开源快速开发平台G4Studio_V5.0版本已经正式发布。
访问G4Studio网站
http://www.g4it.org
2013-04-06 发布G4Studio_V5.0版本
功能新增
(1). 新增了调用Oracle存储过程返回游标,并将游标映射为Java List集合对象的标
- Oracle显示根据高考分数模拟录取
百合不是茶
PL/SQL编程oracle例子模拟高考录取学习交流
题目要求:
1,创建student表和result表
2,pl/sql对学生的成绩数据进行处理
3,处理的逻辑是根据每门专业课的最低分线和总分的最低分数线自动的将录取和落选
1,创建student表,和result表
学生信息表;
create table student(
student_id number primary key,--学生id
- 优秀的领导与差劲的领导
bijian1013
领导管理团队
责任
优秀的领导:优秀的领导总是对他所负责的项目担负起责任。如果项目不幸失败了,那么他知道该受责备的人是他自己,并且敢于承认错误。
差劲的领导:差劲的领导觉得这不是他的问题,因此他会想方设法证明是他的团队不行,或是将责任归咎于团队中他不喜欢的那几个成员身上。
努力工作
优秀的领导:团队领导应该是团队成员的榜样。至少,他应该与团队中的其他成员一样努力工作。这仅仅因为他
- js函数在浏览器下的兼容
Bill_chen
jquery浏览器IEDWRext
做前端开发的工程师,少不了要用FF进行测试,纯js函数在不同浏览器下,名称也可能不同。对于IE6和FF,取得下一结点的函数就不尽相同:
IE6:node.nextSibling,对于FF是不能识别的;
FF:node.nextElementSibling,对于IE是不能识别的;
兼容解决方式:var Div = node.nextSibl
- 【JVM四】老年代垃圾回收:吞吐量垃圾收集器(Throughput GC)
bit1129
垃圾回收
吞吐量与用户线程暂停时间
衡量垃圾回收算法优劣的指标有两个:
吞吐量越高,则算法越好
暂停时间越短,则算法越好
首先说明吞吐量和暂停时间的含义。
垃圾回收时,JVM会启动几个特定的GC线程来完成垃圾回收的任务,这些GC线程与应用的用户线程产生竞争关系,共同竞争处理器资源以及CPU的执行时间。GC线程不会对用户带来的任何价值,因此,好的GC应该占
- J2EE监听器和过滤器基础
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J2EE
Servlet程序由Servlet,Filter和Listener组成,其中监听器用来监听Servlet容器上下文。
监听器通常分三类:基于Servlet上下文的ServletContex监听,基于会话的HttpSession监听和基于请求的ServletRequest监听。
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ServletContex又叫application
- 博弈AngularJS讲义(16) - 提供者
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jsAngularJSapiAngularProvider
Angular框架提供了强大的依赖注入机制,这一切都是有注入器(injector)完成. 注入器会自动实例化服务组件和符合Angular API规则的特殊对象,例如控制器,指令,过滤器动画等。
那注入器怎么知道如何去创建这些特殊的对象呢? Angular提供了5种方式让注入器创建对象,其中最基础的方式就是提供者(provider), 其余四种方式(Value, Fac
- java-写一函数f(a,b),它带有两个字符串参数并返回一串字符,该字符串只包含在两个串中都有的并按照在a中的顺序。
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public class CommonSubSequence {
/**
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* 写一个版本算法复杂度O(N^2)和一个O(N) 。
*
* O(N^2):对于a中的每个字符,遍历b中的每个字符,如果相同,则拷贝到新字符串中。
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- sqlserver 2000 无法验证产品密钥
Chen.H
sqlwindowsSQL ServerMicrosoft
在 Service Pack 4 (SP 4), 是运行 Microsoft Windows Server 2003、 Microsoft Windows Storage Server 2003 或 Microsoft Windows 2000 服务器上您尝试安装 Microsoft SQL Server 2000 通过卷许可协议 (VLA) 媒体。 这样做, 收到以下错误信息CD KEY的 SQ
- [新概念武器]气象战争
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气象战争的发动者必须是拥有发射深空航天器能力的国家或者组织....
原因如下:
地球上的气候变化和大气层中的云层涡旋场有密切的关系,而维持一个在大气层某个层次
- oracle 中 rollup、cube、grouping 使用详解
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oraclegroupingrollupcube
oracle 中 rollup、cube、grouping 使用详解 -- 使用oracle 样例表演示 转自namesliu
-- 使用oracle 的样列库,演示 rollup, cube, grouping 的用法与使用场景
--- ROLLUP , 为了理解分组的成员数量,我增加了 分组的计数 COUNT(SAL)
- 技术资料汇总分享
Dead_knight
技术资料汇总 分享
本人汇总的技术资料,分享出来,希望对大家有用。
http://pan.baidu.com/s/1jGr56uE
资料主要包含:
Workflow->工作流相关理论、框架(OSWorkflow、JBPM、Activiti、fireflow...)
Security->java安全相关资料(SSL、SSO、SpringSecurity、Shiro、JAAS...)
Ser
- 初一下学期难记忆单词背诵第一课
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careful 小心的,仔细的
short 短的
heavy 重的
empty 空的
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- 截取视图的图片, 然后分享出去
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OSObjective-C
OS 7 has a new method that allows you to draw a view hierarchy into the current graphics context. This can be used to get an UIImage very fast.
I implemented a category method on UIView to get the vi
- MySql重置密码
fanxiaolong
MySql重置密码
方法一:
在my.ini的[mysqld]字段加入:
skip-grant-tables
重启mysql服务,这时的mysql不需要密码即可登录数据库
然后进入mysql
mysql>use mysql;
mysql>更新 user set password=password('新密码') WHERE User='root';
mysq
- Ehcache(03)——Ehcache中储存缓存的方式
234390216
ehcacheMemoryStoreDiskStore存储驱除策略
Ehcache中储存缓存的方式
目录
1 堆内存(MemoryStore)
1.1 指定可用内存
1.2 驱除策略
1.3 元素过期
2 &nbs
- spring mvc中的@propertysource
jackyrong
spring mvc
在spring mvc中,在配置文件中的东西,可以在java代码中通过注解进行读取了:
@PropertySource 在spring 3.1中开始引入
比如有配置文件
config.properties
mongodb.url=1.2.3.4
mongodb.db=hello
则代码中
@PropertySource(&
- 重学单例模式
lanqiu17
单例Singleton模式
最近在重新学习设计模式,感觉对模式理解更加深刻。觉得有必要记下来。
第一个学的就是单例模式,单例模式估计是最好理解的模式了。它的作用就是防止外部创建实例,保证只有一个实例。
单例模式的常用实现方式有两种,就人们熟知的饱汉式与饥汉式,具体就不多说了。这里说下其他的实现方式
静态内部类方式:
package test.pattern.singleton.statics;
publ
- .NET开源核心运行时,且行且珍惜
netcome
java.net开源
背景
2014年11月12日,ASP.NET之父、微软云计算与企业级产品工程部执行副总裁Scott Guthrie,在Connect全球开发者在线会议上宣布,微软将开源全部.NET核心运行时,并将.NET 扩展为可在 Linux 和 Mac OS 平台上运行。.NET核心运行时将基于MIT开源许可协议发布,其中将包括执行.NET代码所需的一切项目——CLR、JIT编译器、垃圾收集器(GC)和核心
- 使用oscahe缓存技术减少与数据库的频繁交互
Everyday都不同
Web高并发oscahe缓存
此前一直不知道缓存的具体实现,只知道是把数据存储在内存中,以便下次直接从内存中读取。对于缓存的使用也没有概念,觉得缓存技术是一个比较”神秘陌生“的领域。但最近要用到缓存技术,发现还是很有必要一探究竟的。
缓存技术使用背景:一般来说,对于web项目,如果我们要什么数据直接jdbc查库好了,但是在遇到高并发的情形下,不可能每一次都是去查数据库,因为这样在高并发的情形下显得不太合理——
- Spring+Mybatis 手动控制事务
toknowme
mybatis
@Override
public boolean testDelete(String jobCode) throws Exception {
boolean flag = false;
&nbs
- 菜鸟级的android程序员面试时候需要掌握的知识点
xp9802
android
熟悉Android开发架构和API调用
掌握APP适应不同型号手机屏幕开发技巧
熟悉Android下的数据存储
熟练Android Debug Bridge Tool
熟练Eclipse/ADT及相关工具
熟悉Android框架原理及Activity生命周期
熟练进行Android UI布局
熟练使用SQLite数据库;
熟悉Android下网络通信机制,S