Seurat找到差异基因后 筛选Top10的基因

通常情况下,我们按照logfc从大到小筛选每个cluster的top10差异基因

deg1就是findallmarkers的输出结果,改成自己的就好

deg1 %>%
  group_by(cluster) %>% #按照clusetr分类
  # top_n(n = 10, wt = avg_log2FC) %>% #按照log2fc取前十
  dplyr::arrange(desc(avg_log2FC))%>%
  dplyr::arrange(cluster)-> top10 #按照log2fc降序

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