R语言零基础基因/数据差异分析-热图分析(四)

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  • 结果展示
  • 需要的数据结构
  • 绘制方法

结果展示

R语言零基础基因/数据差异分析-热图分析(四)_第1张图片

需要的数据结构

Q:这个表哪里来的?
A:他来自我的教程第一章开头介绍的,只不过把第一行改成了Symbol, a, b, c…
R语言零基础基因/数据差异分析-热图分析(四)_第2张图片
看过上一篇文章后,你需要自己整理好数据,这里我筛选出所需基因排序。

绘制方法

请仔细阅读代码,并修改部分你需要改的数据

library(pheatmap)

gene = read.csv(file.choose(), header = T, row.names = 1)

pheatmap(log2(gene[,
			1:6 #1:6指的是,我的数据是从第一列到第六列是需要计算的数据(B-G),Excel是从第0列开始数的,请按自己数据改
			]+1),labels_row = gene$
			Symbol #需要改,这里是文档第一列开头名,按自己改
			,main=
			"Heatmap" #标题名,可自己改
			,color = colorRampPalette(c("blue","white","red"))(256)
)

输入后回车,选择你的数据文件即可
R语言零基础基因/数据差异分析-热图分析(四)_第3张图片

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