药物靶点相关数据库

本文会不定期更新药物靶点相关的数据库，先放上数据库名称合集及部分数据库简介，空闲时间再把其他数据库简介补齐。

1. GDSC数据库：

引用：
抗癌药物敏感性数据库GDSC：https://www.bilibili.com/read/cv6018538/
这篇文章较有详细的GDSC的使用步骤。

GDSC可以用于：

1. 药物敏感性基因特征分析；
2. 细胞系药物敏感性数据；
3. 细胞系的基因组突变与CNV变异数据，表达谱数据及甲基化数据；

2. CancerDR 数据库：

主要用途：
① 可以找出属于特定组织类型的细胞系和每种药物的药物敏感性；
② 开发者预测了所有涉及靶点的三级结构及其突变体。
其访问链接：http://crdd.osdd.net/raghava/cancerdr/

CancerDR数据库作者的论文：《CancerDR: Cancer Drug Resistance Database》 (2013-03-13)
开发者是基于CCLE，COSMIC，PubChem和Therapeutic Target数据库进行整合分析的。

开发者共收集了952个细胞系进行了148种抗癌药物的药理学分析（36种FDA批准药物，48种临床试验药物和64种实验药物）。其中，130种药物已用于靶向治疗，18种是细胞毒性药物（截止2013年）。

抗肿瘤药物的靶向点分布

用于药理分析的癌细胞系所属组织占比

建库示意图

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引用：
【收藏】生物数据库大合集： https://zhuanlan.zhihu.com/p/174385626

药物数据库

DGIdb：药物-基因
Pubchem：化合物/信息/结构
CTD：信息/化合物/互作
NRDTD：药物-ncRNA
ETCM：中药/靶分子/功能/疾病
BATMAN-TCM：中药/靶分子/功能/疾病
TCMSP：中药成分/靶分子/疾病
TCMID：中药信息
SymMap : 整合型
VigiBase ：药物不良数据库

引用：
药物靶点搜索数据库：https://zhuanlan.zhihu.com/p/140787824

常用药物靶点搜索查询的数据库：

1. DrugBank
2. PubChem
3. Therapeutic Target Database
4. ChEMBL

https://zhuanlan.zhihu.com/p/79261827?from_voters_page=true