利用gretna计算小世界网络属性等图论指标笔记

文章目录

  • 前言
  • 一、安装GRETNA
  • 二、脑网络图论指标计算
  • 三、输出结果
  • 四、网络图论指标比较
  • 五、统计结果
  • 总结


前言

grena是一个图论网络分析工具箱(包括结构和功能网络),前面我已经使用基于FSL的PANDA得到FA矩阵,那么接下来我就使用FA矩阵进行图论参数的计算,然后进行组间差异的统计分析。接下来计算的网络拓扑属性:
1、小世界网络:聚类系数(clustering coefficient, Cp)、最短路径长度(shortest path length, Lp)、标准化聚类系数(normalized clustering coefficient, γ)、标准化最短路径长度(normalized shortest path length, λ)和小世界属性系数(small-worldness, σ)。
2、全局效率(global efficiency, Eg)
3、富人俱乐部(rich club)
4、节点聚类系数(nodal clustering coefficient)
5、节点最短路径长度(nodal shortest path length)
6、节点效率(nodal efficiency)
7、节点局部效率(nodal local efficiency)

小世界属

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