openslide matlab,LINUX教程：Ubuntu下安装openslide-matlab
《LINUX教程：Ubuntu下安装openslide-matlab》要点：
本文介绍了LINUX教程：Ubuntu下安装openslide-matlab，希望对您有用。如果有疑问，可以联系我们。
跑全扫描图像必要用到openslide这个包,底层是用C语言写的,这里是openslide-python的安装以及详解点击打开链接
解压 用matlab运行openslide_load_library.m这个文件,我出现了这个差错
libopenslide.so.0 not available on the MATLAB path\n
解决方法
起首在终端找到libopenslide.so.0这个文件
locate libopenslide.so.0
于是能获得文件的位置
我的地位是在/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopenslide.so.0
假如找不到,直接在linux系统文件夹里搜索也行
然后将openslide_load_library.m中的第45行的
libName = libopenslide.so.0 改成
libName =('/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopenslide.so.0');
然后继续运行openslide_load_library.m这个文件,可能又出现类似的差错,怒了,matlab的which()这个语句不咋地,
将下面一行的 which(libName)直接改成
'/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopenslide.so.0'
然后继续运行openslide_load_library.m这个文件
openslide.h not available on the MATLAB path这个差错
继续在终端运行
locate openslide.h
这时候应该能发现openslide.h文件在的地位,
同样假如找不到,直接在linux系统文件夹里搜索也行
将第53行openslideHeaderLocation = which('openslide.h');这一句改成
openslideHeaderLocation = ('/home/hjxu/openslide-3.4.1/src/openslide.h');
目前安装就已经结束了,但是我呈现了一个问题
我的机器里没有openslide.h这个文件,locate找不到地位,思前想后,可能我在安装openslide-python的时候是用命令安装的,所以找不到这个文件
重新安装openslide-python这个包,下载地址http://openslide.org/download/
下载的是3.4.1,依据readme显示
首先得安装一些需要的库,避免一些不需要的麻烦,无论有用与否
1. sudo apt-get install libopenjpeg-dev libsqlite3-dev
2. sudo apt-get install openslide-tools
3. sudo apt-get install python-openslide
4. sudo apt-get install python3-openslide
cd openslide-3.4.1/
sudo ./configure
To build the library, type from source tree directory:
mkdir build
cd build
cmake ..
make
Binaries are then located in the 'bin' directory.
To install the library, type with root privileges:
make install
make clean
To build the html documentation, you need doxygen to be installed on your system.It will create an "html" directory in TOP_LEVEL/build/doc)
make doc
然后再
cd openslide-3.4.1/
sudo ./configure
提醒缺少No package 'sqlite3' found
安装splite3
sudo apt-get install sqlite sqlite3
然后就ok了,这时候再locate openslide.h就能发现地位了,我的地位是在
/home/hjxu/openslide-3.4.1/src/openslide.h
然后变动openslide_load_library.m
将第53行openslideHeaderLocation = which('openslide.h');这一句改成
openslideHeaderLocation = ('/home/hjxu/openslide-3.4.1/src/openslide.h');
再运行openslide_load_library.m就OK了
可以测验考试运行openslide_example.m 不报错就可以了,祝好运.
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