生态环境领域基于R语言piecewiseSEM结构方程模型

结构方程模型(Sructural Equation Modeling,SEM)可分析系统内变量间的相互关系,并通过图形化方式清晰展示系统中多变量因果关系网,具有强大的数据分析功能和广泛的适用性,是近年来生态、进化、环境、地学、医学、社会、经济等众多领域应用十分广泛的统计方法。

在R语言结构方程程序包中,piecewiseSEM语法简洁,将结构方程模型拆分为多个组分(component)模型进行拟合和评估,可与混合效应模型实现无缝对接,在应对研究系统中复杂数据结构和类型,如多层数据嵌套和非正态分布类型变量(二项分布、泊松分布),有明显的优势。因而,在生态环境领域得到广泛应用,是该领域颇受欢迎的结构方程模型程序包。

基于R语言piecewiseSEM程序包,通过理论讲解和实际操作相结合的方式,由浅入深地系统介绍结构方程模型的建立、拟合、评估、筛选和结果展示的全过程。我们筛选大量经典案例,这些案例来主流期刊,具有很大的参考和借鉴价值。训练内容包括R语言入门、结构方程模型原理简介、piecewise包简介及应用案例、非正态分布变量分析、嵌套/分层/多水平数据分析、重复测量和时间数据分析、空间自相关数据分析、系统发育数据分析、复合变量分析、分类变量、非线性数据及数据分组分析

内容的设置是基于多年来与学员沟通和交流,使大家能够利用piecewiseSEM解决构建结构方程模型过程中的众多困扰

R/Rstudio简介及入门【提供视频、教材、相关案例数据代码】

(1) R及Rstudio介绍:背景、软件及程序包安装、基本设置等

(2) R语言基本操作,包括向量、矩阵、数据框及数据列表等生成和数据提取等

(3) R语言数据文件读取、整理(清洗)、结果存储等(含tidverse)

(4) R语言基础绘图(含ggplot):基本绘图、排版、发表质量绘图输出存储

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结构方程模型(SEM)介绍

(1) SEM的定义、生态学领域应用及历史回顾

(2) SEM的基本结构

(3) SEM的估计方法

(4) SEM的路径规则

(5) SEM路径参数的含义

(6) SEM分析样本量及模型可识别规则

(7) SEM构建基本流程

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piecewise包简介及应用案例

(1) 结构方程模型在生态学研究中的应用介绍及要点回顾

(2) piecewiseSEM结构方程模型基本原理

(3) piecewiseSEM结构方程模型构建应用案例

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piecewiseSEM非正态分布变量分析

(1) 非正态分布数据VS非正态分布变量

(2) piecewiseSEM处理非正态变量的注意事项

(3) piecewiseSEM处理二项分布和泊松分布案例

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piecewiseSEM嵌套/分层/多水平数据分析

(1) 嵌套/多水平/分层数据概述

(2) piecewiseSEM与混合/多水平/分层模型的结合

(3) 均衡和不均衡结构嵌套/多水平/分层数据结构方程实例

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piecewiseSEM处理重复测量和时间数据

(1) 时间重复测量数据特点简介

(2) 时间/重复测量数据的自相关问题

(3) piecewiseSEM处理时间自相关问题实例

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piecewiseSEM处理空间自相关数据

(1) 数据空间自相关概述

(2) piecewiseSEM处理空间自相关数据基本原理

(3) piecewiseSEM处理空间自相关问题实例

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piecewiseSEM处理系统发育数据

(1) 系统发育相关问题介绍

(2) 系统发育相关数据纳入结构方程模型实现途径

(3) piecewiseSEM系统发育相关数据纳入结构方程实例

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piecewiseSEM复合变量(composite)分析

(1) 复合变量的定义及在生态学领域应用情景分析

(2) piecewiseSEM复合变量分析实现途径

(3) piecewiseSEM复合变量分析案例

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piecewiseSEM处理分类变量

(1) 非线性数据简介

(2) piecewiseSEM处理非线性数据途径及案例

(3) piecewiseSEM处理变量间交互作用关系方式及案例

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piecewiseSEM数据分组(multigroup)分析

(1) 分组数据vs分类变量vs交互作用

(2) 数据分组分析实现途径

(3) 二分组及多分组模型分析及结果表达

(4) 分组分析案例

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R语言贝叶斯方法在生态环境领域

R语言混合效应(多水平/层次/嵌套)模型及贝叶斯实现

大尺度空间模拟预测与数字制图

R语言的Meta分析【全流程、不确定性分析】方法与Meta机器学习

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