出版级PCA美图，轻松拿捏（主成分分析利器，建议收藏备用）

功能描述

这个工具用于进行主成分分析（PCA, Principal Component Analysis），可生成出版级图形。

工具位置

UseGalaxy.cn > RNA-seq > PCA plot with FactoMineR

数据准备

文件1：矩阵文件

• 第1列：特征，如基因。

• 第2 - 最后一列：样本的值，如表达量。 

文件2：样本信息

• 第1列：样本ID。

• 第2列：分组。 

使用示例

• 默认参数

• 高级设置

  • 边界线形状：多边形

• 高级设置

  • 边界线形状：无边界线

• 颜色美学

  • 主题：theme_minimal

• 颜色美学

  • 调色板为：JCO

• 图例设置

  • 位置：right

关于简说基因

• 生信平台

  简说基因创建了Galaxy中国社区（UseGalaxy.cn），致力于将生信分析都迁到云上。Galaxy中国为所有用户提供免费服务，热情欢迎广大生物医学研究者使用。

• 生信培训

  简说基因的生信培训班，荣获学员的一致好评。如果你也对生物信息学感兴趣，欢迎来跟简说基因，学真生信。
  

• 生信分析

  我们能够承接所有 NGS 组学数据分析业务，包括但不限于 WGS / WES / RNA-seq 等。基因组组装、注释，以及各种重测序业务都可以与简说基因合作。