药物研发常用数据库

介绍一些医药研发中常用的数据库，网址及说明如下，欢迎取用： 

	数据资源	简介	网址	说明
1	PDB	蛋白质序列及结构数据库	RCSB PDB: Homepage	蛋白相关类
2	PDBsum	与PDB数据库类似，更便于查询蛋白配体相互作用信息	PDBsum home page
3	Uniprot	关于蛋白质的全部信息	UniProt
4	STRING	蛋白互相作用关系的数据库	https://string-db.org/
5	STITCH	化合物与蛋白质之间的互作关系	STITCH: chemical association networks	化合物-靶点类
6	BindingDB	药物靶点的蛋白质与小的药物样分子的相互作用	Binding Database Home
7	drug2gene	化合物-靶标为中心的数据库	Gene2drug
8	GEO DataSets	基因表达数据集	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds/	基因相关类
9	NCBI Gene	关于基因的全面信息	https://ncbi.nlm.nih.gov/gene
10	Ensembl	关于基因的全面信息	Ensembl genome browser 108
11	Connectivity map (Cmap)	细胞被化合物处理前后的基因表达数据集	GEO Accession viewer
12	GTExPortal	不同靶点在不同的组织中的表达量	GTEx Portal
13	reactome	蛋白通路数据库	Home - Reactome Pathway Database	通路
14	WikiPathways	公共管理的通路数据库	WikiPathways - WikiPathways
15	Pathway Commons	通路元数据库	Pathway Commons: A Resource for Biological Pathway Analysis
16	KEGG	通路数据库	KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes
17	PubChem	有机小分子生物活性数据	PubChem	化合物类
18	DrugBank	药品类型，简介，化学结构，成分，临床实验，药物靶点等	https://go.drugbank.com/
19	ChEMBL	生化活性数据库	ChEMBL Database
20	ChemBank	生化活性数据库	ChemBank - view assays
21	Ligand Expo	PDB中结合的配体数据集	Ligand Expo Downloads
22	ChemSpider	化合物性质	ChemSpider | Search and share chemistry
23	ZINC	免费的化合物虚拟筛选数据库	ZINC
24	ClinicalTrials	临床试验数据库	Home - ClinicalTrials.gov	其它
25	ReDO_DB	老药新用相关数据库	ReDO_DB - Drug Repurposing Database | Anticancerfund
26	CLUE  THE DRUG REPURPOSING HUB	老药新用相关数据库	THE DRUG REPURPOSING HUB
27	OMIM	孟德尔疾病目录	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/omim
28	Achilles	肿瘤细胞系的RNAi筛选	DepMap: The Cancer Dependency Map Project at Broad Institute
29	CTD2	化合物探针集对肿瘤细胞系的作用	http://www.ctd2.nci.nih.gov/
30	PhenomicDB	表型-疾病关系的元数据库	PhenomicDB: a multi-species genotype/phenotype database for comparative phenomics | Bioinformatics | Oxford Academic
31	opentargets	靶标-疾病相关性证据的数据库	Home - Open Targets
32	GWAS Catalog	基因单核苷酸多态性与疾病关系的目录	GWAS Catalog
33	HuGe Navigator	基因-疾病联系	HuGE Navigator|Home|PHGKB
34	CCLE	肿瘤细胞系百科全书	Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE)
35	TCGA	肿瘤患者的基因组信息	The Cancer Genome Atlas Program - NCI