2021-09-04

Aging-US | circRNA-lncRNA-miRNA-mRNA作用网络研究发现HCC预后标志物

原创 图灵基因 图灵基因 今天

收录于话题#前沿分子生物学机制

大多数患有肝细胞癌 (HCC)（最常见的肝癌形式）的患者在晚期阶段首次被发现，已无法通过手术切除受影响组织。由于在疾病的早期阶段缺乏明显的临床症状，对疾病过程的生物学和分子复杂性缺乏深入的了解，以及缺乏有效的HCC生物标志物，诊断后的生存期仍然很短。

“HCC作为最常见的肝癌类型，已成为癌症相关死亡的主要原因之一，也是一个引起广泛关注的全球健康问题。”来自华中科技大学和湖北省肝胆胰疾病重点实验室的Huifang Liang博士和Bixiang Zhang博士说。

最近的几项研究发现，调控竞争性内源性RNA (ceRNA)网络的机制会影响HCC的发生和发展。ceRNA网络是一个复杂的转录后调控网络，其中环状RNA (circRNA)、长链非编码RNA (lncRNA)和蛋白质编码mRNA通过至少一个共享的miRNA反应元件(MRE)与microRNA (miRNA)竞争。

由中国湖北同济医学院的科学家们领导的一项新研究调查了ceRNA网络，以更好地了解HCC中复杂的基因相互作用，并确定诊断和治疗HCC的潜在生物标志物。

他们的研究结果发表在《Aging-US》杂志上的一篇题为“Comprehensive analysis of the competing endogenous circRNA-lncRNA-miRNA-mRNA network and identification of a novel potential biomarker for hepatocellular carcinoma”的文章中，可能有助于更好地理解ceRNA驱动HCC的机制，为评估HCC的预后提供新的生物标志物。

研究人员比较公共TCGA和GEO数据库中可用的RNA测序数据，以确定在HCC和正常组织中不同水平表达的mRNA、lncRNA和circRNA，并预测差异表达（DE）circRNA和lncRNA的靶向miRNA，以构建HCC的预后circRNA-lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络。他们建立了一个七基因的HCC标记，并验证了预后标记中的一个中枢基因DTYMK，作为一种新的潜在生物标志物。

基于7个hub-mRNA与其他RNA之间的靶向关系，研究人员建立了由21个circRNA、15个lncRNA、5个miRNA和7个mRNA组成的ceRNA预测网络。

作者指出，目前研究的局限性在于，进行体内和体外实验以验证DTYMK在HCC中的功能超出了研究范围，需要在未来的研究中进行。他们还建议，在未来的实验中验证其他中枢ncRNA在预测ceRNA网络中的作用。