注意：此代码实现的是求目标函数最大值，求最小值可将适应度函数乘以-1（框架代码已实现）。
注意：此代码实现的是求目标函数最大值，求最小值可将适应度函数乘以-1（框架代码已实现）。
注意：此代码实现的是求目标函数最大值，求最小值可将适应度函数乘以-1（框架代码已实现）。
1.代码实现
不了解黏菌算法可以先看看优化算法笔记（三十三）黏菌算法
实现代码前需要先完成优化算法matlab实现（二）框架编写中的框架的编写。
| 文件 | 名描述 |
|---|---|
| ..\optimization algorithm\frame\Unit.m | 个体 |
| ..\optimization algorithm\frame\Algorithm_Impl.m | 算法主体 |
以及优化算法matlab实现（四）测试粒子群算法中的测试函数、函数图像的编写。
| 文件名 | 描述 |
|---|---|
| ..\optimization algorithm\frame\Get_Functions_details.m | 测试函数，求值用 |
| ..\optimization algorithm\frame\func_plot.m | 函数图像，画图用 |
黏菌算法的个体有一个独有属性：权重。
黏菌算法个体
文件名：.. \optimization algorithm\algorithm_slime_mould\SMA_Unit.m
% 黏菌算法个体
classdef SMA_Unit < Unit
properties
% 权重
weight;
end
methods
function self = SMA_Unit()
end
end
end
黏菌算法算法主体
文件名：..\optimization algorithm\algorithm_slime_mould\SMA_Base.m
% 黏菌算法
classdef SMA_Base < Algorithm_Impl
properties
% 算法名称
name = 'SMA';
% 变异系数
Z = 0.03;
end
% 外部可调用的方法
methods
function self = SMA_Base(dim,size,iter_max,range_min_list,range_max_list)
% 调用父类构造函数
self@Algorithm_Impl(dim,size,iter_max,range_min_list,range_max_list);
self.name ='SMA';
end
end
% 继承重写父类的方法
methods (Access = protected)
% 初始化种群
function init(self)
init@Algorithm_Impl(self)
%初始化种群
for i = 1:self.size
unit = SMA_Unit();
% 随机初始化位置：rand(0,1).*(max-min)+min
unit.position = unifrnd(self.range_min_list,self.range_max_list);
% 计算适应度值
unit.value = self.cal_fitfunction(unit.position);
% 将个体加入群体数组
self.unit_list = [self.unit_list,unit];
end
end
% 每一代的更新
function update(self,iter)
update@Algorithm_Impl(self,iter)
% 更新权重
self.update_weight();
% 更新位置
self.update_position(iter);
end
% 更新权重
function update_weight(self)
% 从大到小排序，数值越大越优
[value,index] = sort([self.unit_list.value],'descend');
% 最优值与最差值的绝对值
s = abs(value(1)-value(end)) + realmin('double');
for i = 1:self.size
if i < self.size/2
new_weight = 1 + unifrnd(0,1,1,self.dim).*log10(1+(value(1)-self.unit_list(index(i)).value)/s);
else
new_weight = 1 - unifrnd(0,1,1,self.dim).*log10(1+(value(1)-self.unit_list(index(i)).value)/s);
end
self.unit_list(index(i)).weight = new_weight;
end
end
% 更新位置
function update_position(self,iter)
% 从大到小排序，数值越大越优
[value,index] = sort([self.unit_list.value],'descend');
a = atanh(1-iter/self.iter_max);
b = 1-iter/self.iter_max;
for i = 1:self.size
if rand < self.Z
% 变异操作，解空间内随机初始化
self.unit_list(index(i)).position = unifrnd(self.range_min_list,self.range_max_list);
self.unit_list(index(i)).value = self.cal_fitfunction(self.unit_list(index(i)).position);
else
p = tanh(abs(self.value_best - self.unit_list(index(i)).value));
if rand < p
% 随机选择两个个体
A = randperm(self.size,1);
B = randperm(self.size,1);
new_pos = self.position_best+unifrnd(-a,a,1,self.dim).*(self.unit_list(A).weight.*self.unit_list(A).position - self.unit_list(B).position);
else
new_pos = unifrnd(-b,b,1,self.dim).*self.unit_list(index(i)).position;
end
new_pos = self.get_out_bound_value(new_pos);
new_value = self.cal_fitfunction(new_pos);
self.unit_list(index(i)).value = new_value;
self.unit_list(index(i)).position = new_pos;
end
end
end
% 获取当前最优个体的id
function best_id=get_best_id(self)
% 求最大值则降序排列
[value,index] = sort([self.unit_list.value],'descend');
best_id = index(1);
end
end
end
文件名：..\optimization algorithm\algorithm_slime_mould\SMA_Impl.m
算法实现，继承于Base,图方便也可不写，直接用SMA_Base，这里为了命名一致。
% 黏菌算法实现
classdef SMA_Impl < SMA_Base
% 外部可调用的方法
methods
function self = SMA_Impl(dim,size,iter_max,range_min_list,range_max_list)
% 调用父类构造函数设置参数
self@SMA_Base(dim,size,iter_max,range_min_list,range_max_list);
end
end
end
2.测试
测试F1
文件名：..\optimization algorithm\algorithm_slime_mould\Test.m
%% 清理之前的数据
% 清除所有数据
clear all;
close all;
% 清除窗口输出
clc;
%% 添加目录
% 将上级目录中的frame文件夹加入路径
addpath('../frame')
%% 选择测试函数
Function_name='F1';
%[最小值，最大值，维度，测试函数]
[lb,ub,dim,fobj]=Get_Functions_details(Function_name);
%% 算法实例
% 种群数量
size = 50;
% 最大迭代次数
iter_max = 1000;
% 取值范围上界
range_max_list = ones(1,dim).*ub;
% 取值范围下界
range_min_list = ones(1,dim).*lb;
% 实例化黏菌算法类
base = SMA_Impl(dim,size,iter_max,range_min_list,range_max_list);
base.is_cal_max = false;
% 确定适应度函数
base.fitfunction = fobj;
% 运行
base.run();
disp(base.cal_fit_num);
%% 绘制图像
figure('Position',[500 500 660 290])
%Draw search space
subplot(1,2,1);
func_plot(Function_name);
title('Parameter space')
xlabel('x_1');
ylabel('x_2');
zlabel([Function_name,'( x_1 , x_2 )'])
%Draw objective space
subplot(1,2,2);
% 绘制曲线，由于算法是求最大值，适应度函数为求最小值，故乘了-1，此时去掉-1
semilogy((base.value_best_history),'Color','r')
title('Objective space')
xlabel('Iteration');
ylabel('Best score obtained so far');
% 将坐标轴调整为紧凑型
axis tight
% 添加网格
grid on
% 四边都显示刻度
box off
legend(base.name)
display(['The best solution obtained by ',base.name ,' is ', num2str(base.value_best)]);
display(['The best optimal value of the objective funciton found by ',base.name ,' is ', num2str(base.position_best)]);