单细胞从理论到实践-这一本书就够了

前面给大家介绍过一些单细胞相关的理论和实践知识

  1. BD单细胞测序平台Rhapsody(视频)

  2. 10X单细胞RNA-seq技术(视频)

  3. 10X单细胞混样技术(视频)

  4. 单细胞ATAC-seq技术介绍

  5. 免疫组库

  6. 10X Genomics VDJ测序

  7. 10X Genomics的Visium空间基因表达解决方案

  8. 空间转录组学(Spatial Transcriptomics)

  9. 单细胞数据分析相关R包安装(视频)

  10. 单细胞小提琴图+箱型图

  11. Seurat单细胞绘图函数DimHeatmap边界无法调整

  12. 单细胞DoHeatmap画热图标签出界

  13. unstack函数应用——生成单细胞marker基因表格

  14. 为什么要选择单细胞核RNA测序?

  15. PBMC or 全血,应该选哪个?

  16. 单细胞测序公共数据库(上)

  17. 单细胞测序公共数据库(下)

  18. 单细胞转录组数据检索新方法和参考数据库

  19. 首个单细胞空间转录组数据分析可视化平台

  20. 单细胞类型注释工具singleR

  21. 基于人工智能度量学习的单细胞类型鉴定新方法

  22. 单细胞SCENIC分析——寻找驱动基因

  23. 单细胞转录组测序数据质控

  24. scRNA-Seq数据预处理

  25. 单细胞转录组数据分析——降维

  26. 单细胞RNA数据标准化与聚类分析

  27. 单细胞去除批次效应软件比较

  28. 单细胞测序的三种方式

  29. 人类细胞图谱 — 让你的细胞注释更简单

  30. 单细胞等高线图

今天给大家安利一本比较系统的介绍单细胞原理到利用R做数据分析的电子书

由Bioconductor出品,品质肯定有保障。

http://bioconductor.org/books/release/OSCA/

下面是这本书的目录,可以看到基本上囊括了单细胞数据分析的方方面面。从质控(QC)到归一化,从特征筛选到降维,从聚类到marker基因挑选,从细胞亚群鉴定到数据整合。从单个样本分析,到多个样本的比较。从单细胞RNA测序到多组学联合分析。还包括了拟时序分析,免疫组库分析,最新的细胞核测序。理论结合实践。真实单细胞测序数据+R代码实操。把这本书啃完,应该可以算半个单细胞专家了。赶紧练起来吧!

单细胞从理论到实践-这一本书就够了

你可能感兴趣的:(单细胞从理论到实践-这一本书就够了)