plink清除snp位点

1.检查重复的样本或变异信息： 使用 PLINK 的命令来查找并移除重复的信息。例如可以使用 --list-duplicates 来列出重复的个体或变异，然后使用 --remove 或 --exclude 参数将其剔除。

2.确保数据唯一性： 确保你的数据中个体和变异信息的标识符是唯一的。有时候数据处理或者合并过程中可能会导致重复。

3.检查数据源： 如果这些数据是从不同的来源合并而来，可能存在重复的情况。重新检查原始数据并确保数据的唯一性。

plink --file input --list-duplicate-vars
plink --file input --exclude <file_with_duplicates_to_remove.txt> --make-bed --out output