学习小组Day3笔记--amy

linux环境下的软件安装

准备工作--安装和配置miniconda

conda是linux系统的“应用商店”，miniconda则包括conda、python还有一些基础包。一般生信工作者使用miniconda即可。

如何使用conda

1. 查看当前所有软件列表
   conda list
2. 搜索软件
   conda search fastqc
3. 安装软件 -y是自动安装
   conda install fastqc -y
4. 卸载软件
   conda remove fastqc -y

创建多个conda环境

• 查看当前conda环境
  conda info --envs
  
  当前conda环境
• 建立名为rnaseq的conda环境，然后指定python版本是3，并安装软件fastqc、trimmomatic
  conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
• 激活新的conda环境
  conda activate rna-seq
  
  conda环境变成rna-seq

心得

真的很感谢制作人把安装步骤写的这么详细，让我一次就安装成功了。我之前也曾尝试自学linux， 不记得是在哪找的方法，还大费周章地安装了VMware虚拟机，现在才知道没必要这么麻烦。看来找到合适的学习资料很关键呐！