学习小组day3笔记－luckyyy_

linux的应用商店

一.linux如何安装软件

1.conda－“linux的应用商店”与app store－“苹果”的关系一样
2.给服务器下载miniconda（conda的精华版）
3.安装和配置miniconda
4.使用miniconda，查看已安装的软件，搜索，安装及卸载生信所需软件

二.下载miniconda

1.查看服务器位数，输入uname －a

2.wget命令 下载conda

三.安装miniconda

1. bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

2.记得要安装完之后还需要激活～
命令行输入conda，出现满屏的信息就是激活成功啦

3.添加镜像

将讲义中所提供的代码粘贴到linux，再回车

conda已经下载和安装完成啦，接下来使用conda

四.开始使用conda

1.查看当前所有软件列表：conda list

2.搜索软件：conda search fastqc

3.安装软件：conda install fastqc －y（－y是自动安装）

4.卸载软件：conda remove fastqc －y

五.conda环境

1.查看当前conda有哪些环境：conda info －－envs（＊为默认）

2.建立名叫rnaseq的conda环境，制定python版本为3，安装软件fastqc，trimmomatic：
conda create －n rnaseq python＝3 fastqc trimmomatic

3.创建完之后，再看下我们的conda环境

多了rna－seq，但默认还是base

4.激活新的conda环境：conda activate rna-seq

新的conda环境可以使用啦

以上就是今天的学习笔记啦～谢谢花花的讲解。