2021-07-03 RNA m6A修饰位点鉴定新策略-1

  今天介绍两种不依赖m6A抗体的RNA m6A修饰位点鉴定新策略：m6A-label-seq与m6A-SEAL-seq。
  m6A-label-seq [1] 通过细胞自身代谢对全转录组RNA m6A位点进行标记，转化为N6-烯丙基腺嘌呤（a6A），a6A进一步通过化学处理转化为1,6位环化腺嘌呤(cyc-A)，依靠cyc-A在逆转录过程中引入的碱基突变，进而实现不依赖抗体的m6A单碱基分辨率检测。

m6A-label-seq

  m6A-SEAL-seq [2]则通过m6A消码器FTO将m6A转化为N6-羟甲基腺嘌呤(hm6A)，进一步通过化学反应，在m6A位点上标记生物素(Biotin)，通过链霉亲和素珠捕获，从而富集含有m6A修饰的RNA片段，结合高通量测序技术进行不依赖抗体的m6A检测。

m6A-SEAL-seq

Reference
[1] Shu X, Cao J, Cheng M, et al. A metabolic labeling method detects mA transcriptome-wide at single base resolution. Nature chemical biology, 2020, 16: 887-895
[2] Wang Y, Xiao Y, Dong S, et al. Antibody-free enzyme-assisted chemical approach for detection of N-methyladenosine. Nature chemical biology, 2020, 16: 896-903