vscode 配置R

conda solving environment慢:

其中一个方法:更新conda

 conda upgrade -n base -c defaults --override-channels conda

conda solving environment慢:

第二个方法:安装mamba

conda install -c conda-forge mamba
mamba install 包名

安装完之后就可以使用mamba来替代conda进行所有下载操作

VScode连接远程服务器创建jupyter后运行R

使用conda search r-base在conda的频道中检索都有什么版本的R

为R创建一个虚拟环境,推荐通过新建环境的方式安装不同版本的R语言,这样就能在不同环境间切换,然后在该虚拟环境下安装ipykernel,为了能运行jupter

conda create -n r-4.2.2 r-base=4.2.2
source activate r-4.2.2
#添加镜像源
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge 
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/pytorch/
conda config --set show_channel_urls yes
#
conda install ipykernel

#用Jupyter notebook调用R,再下载一个irkernel

conda install -c r r-irkernel 

然后在puuty里打开R,激活内核(这个回头有空再确认下)

IRkernel::installspec()

服务器上下载R包不要在vscode里install.package,这样子很奇怪而且报错信息也看不太到。就直接在putty里激活虚拟环境,进入R,然后install.packages

这个stringr包死活下载不下来!!!!
vscode 配置R_第1张图片
解决办法:重新创建了一个虚拟环境,然后conda下stringr就好了。(马上要被气死了啊啊啊啊┭┮﹏┭┮)

conda create --name r4.0
conda install r-base
conda install r-stringr

然后安装languageserver也成功了

 install.packages("languageserver")

conda install -c conda-forge r-seurat


然后在vscode里运行R

参考添加链接描述和添加链接描述这两个链接

注意:vscode里前面的配置好之后,新建一个R文件,然后下面有一个termial,就类似putty里的终端,需要在这里面切到虚拟环境,然后打开radian(直接输入randian即可)

然后就可以在这里用install.package了,跟在putty里一样

但是还是不能用view和显示图片
https://cloud.tencent.com/developer/article/1678113

第二个参考链接

第三个

https://blog.csdn.net/Happievening/article/details/117417696

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