推荐一本生物信息学相关在线电子书

我是在找snakemake参考资料的时候找到的这本在线电子书,链接是

https://eriqande.github.io/eca-bioinf-handbook/

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查了下作者的信息,这个是作者的主页

https://eriqande.netlify.app/

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全书总共29个章节,但是其中某些章节还没有写完

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前面14个章节介绍了

  • linux操作系统的一些知识
  • shell编程
  • sed awk 命令
  • 正则表达式
  • 计算集群
  • Rstudio
  • markdown
  • snakemake

后面的章节主要介绍了一些生物信息学的内容

  • 文件格式
  • 基因组组装(我看了这一章没有写完)
  • 变异检测
  • 操作vcf文件
  • 扩增子测序
  • 27章是从原始测序数据到最终变异结果的一个完整流程,提供数据代码,不过代码的写法涉及到计算集群的使用,好像还涉及到snakemake
  • 最后介绍到了群体基因组学

我是重点看了snakemake 那一章节,写的还挺详细的。

如果你正在学习生物信息学,可以找这本书来参考参考

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