WGCNA终于安装成功了。

先说安装测试环境
操作系统：windows7-32bit
R语言版本：R4.1.2+Rstudio1.1
Bioc版本：Bioconductor version 3.14 (BiocManager 1.30.16)
这里最主要的还是R语言版本的选择。
R3.4.4 R3.6.3两个版本都没成功，碰到一堆问题。
R4.1.2安装WGCNA相对简单一点，这里就以它为例吧。

安装时，我直接使用R4.1.2中的R.exe进行安装的。

01.png

install.packages('WGCNA')

之后会弹出一个镜像源选择框，这里选China(Beijing 2)[https]

mirror.png

安装完成后，试试能否加载成功

library(WGCNA)
#####################################
Error: package or namespace load failed for ‘WGCNA’ in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]):
不存在叫‘GO.db’这个名字的程辑包
In addition: Warning message:
R graphics engine version 14 is not supported by this version of RStudio. The Plots tab will be disabled until a newer version of RStudio is installed.

没有GO.db，就安装一下
BiocManager::install('GO.db')

安装过程还算顺利，然后再试试加载WGCNA包。

library(WGCNA)
#####################################
Error: package or namespace load failed for ‘WGCNA’ in loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]):
不存在叫‘impute’这个名字的程辑包

没有impute，就安装一下
BiocManager::install('impute')

安装过程还算顺利，然后再试试加载WGCNA包。

library(WGCNA)
####################################
Error: package or namespace load failed for ‘WGCNA’ in loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]):
不存在叫‘preprocessCore’这个名字的程辑包

没有preprocessCore，就安装一下
BiocManager::install('preprocessCore')

安装过程还算顺利，然后再试试加载WGCNA包。

library(WGCNA)
#####################################
载入程辑包：‘WGCNA’
The following object is masked from ‘package:stats’:
cor

再试试能否加载

library(WGCNA)
无任何提示信息，表明加载成功，可以正常使用了。

这里为了省事，选了一个简单安装的版本，实在不想折腾的死去活来了。